2020 年 5 月欧洲分子基因诊断质量联盟(EMQN)发布的《抗肌萎缩蛋白病的基因检测》最佳实践指南,是对 2010 年版指南的更新,适配新型基因技术与个性化药物的应用需求,其核心内容围绕检测技术、检测策略、变异解读等多方面展开,为抗肌萎缩蛋白病的基因检测提供全面规范,以下是详细解读:
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明确核心检测技术与适用场景
指南总结了针对 DMD 基因的多种检测技术及适用方向,覆盖不同类型变异检测需求。一是外显子缺失 / 重复检测,多重连接依赖探针扩增技术(MLPA)是该类变异检测的常用技术,能精准识别单或多外显子的缺失与重复情况,这也是抗肌萎缩蛋白病中较常见的变异类型;二是微小变异检测,可借助二代测序技术,比如神经肌肉病靶向二代测序、全外显子组测序等,以此捕获点突变等微小变异;三是 RNA 分析,当 DNA 水平检测结果不确定,如遇到致病性不明的变异时,RNA 分析可辅助判断变异对基因转录的影响,进一步明确变异致病性。
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划分多元检测策略
指南针对不同检测目的制定了差异化策略,适配临床诊断、遗传筛查等不同场景。
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临床诊断:对于有进行性肌无力等典型症状的男性患者,可优先用 MLPA 开展 DNA 水平常规检测,若未发现异常或变异致病性不明,再进一步行 DMD 基因全长测序,甚至结合骨骼肌抗肌萎缩蛋白的蛋白水平分析辅助确诊;女性携带者常表现为肌酸激酶浓度升高,可通过 MLPA 或二代测序进行携带者检测,明确是否携带致病性变异。
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产前诊断:既包含侵入性诊断,如对有家族史的孕妇,可通过羊膜腔穿刺等获取胎儿样本,用 MLPA 等技术检测 DMD 基因变异;也涵盖无创产前诊断,结合胎儿游离 DNA 检测技术,降低侵入性操作带来的风险。同时指南支持染色体微阵列分析(CMA)联合 MLPA 技术,便于检出无家族史但因产前筛查高风险等情况的胎儿的 DMD 基因变异,并明确变异来源。
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规范变异注释与结果报告
变异解读方面,指南要求参照相关遗传学标准,结合变异的位置、类型及对蛋白结构功能的影响等综合判断致病性。例如对于同义变异、错义变异,需结合剪接算法预测结果,辅助判断其是否影响基因剪接。结果报告上,指南提出要清晰呈现检测到的变异类型、致病性评估依据、检测技术局限性等关键信息。比如若检测采用 MLPA 技术,需注明该技术对某些复杂结构变异可能存在检测盲区,避免临床因报告信息不全导致误判。
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关注特殊情况与临床延伸价值
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特殊变异情况处理:针对非连续缺失、双重 DMD 变异等非典型发现,指南提示需结合多种检测技术交叉验证,避免遗漏复杂变异。对于临床未怀疑抗肌萎缩蛋白病却意外检出 DMD 基因变异的情况,需标注为偶然发现,并建议进一步结合临床表型评估及遗传咨询。
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对接个性化医疗:指南提及检测结果需为个性化治疗和临床研究提供支撑。比如特定 DMD 基因变异类型可作为基因治疗的靶点,精准的基因检测结果能帮助患者筛选适配的临床治疗方案与临床试验项目,推动诊疗一体化。