《新生儿常见呼吸道病毒感染预防的专家建议》可能会指出新生儿呼吸道合胞病毒（RSV）感染面临诸多问题，主要包括以下几个方面：
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缺乏特效治疗药物：目前对儿童 RSV 感染有明确疗效的只有干扰素，临床上使用的抗病毒药利巴韦林、白三烯受体拮抗剂、高渗盐水雾化吸入等药物和治疗手段，因疗效尚不明确，不被推荐为常规用药。针对 RSV 感染，临床上通常采取对症支持治疗，抗病毒药通常只对重症 RSV 感染的患儿使用。
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疫苗研发困难：RSV 疫苗研发已进行了 60 多年，但国内外均未有 RSV 疫苗成功获批上市。RSV 表面的 F 蛋白结构不稳定，增加了疫苗研发难度，且常用的 RSV 感染动物模型不能完全模拟 RSV 在人体内的免疫反应和致病情况，缺乏 RSV 感染的血清学标志物也导致无法对疫苗有效性进行反复试验。
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监测系统不完善：中国是全球因 RSV 感染导致儿童下呼吸道感染人数最多的国家之一，但尚未建立起全国性的 RSV 监测系统。目前只有一些进行流感监测的地方性哨点医院对包括 RSV 在内的病原体进行监测，不同研究所使用的监测方案和病例定义不同，导致结果难以比较，且监测连续性欠缺。
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新生儿易感性高：RSV 是全世界范围引起 5 岁以下儿童急性下呼吸道感染最重要的病原体之一，也是导致 1 岁以下婴儿罹患急性下呼吸道感染住院的首要病毒。6 月龄以下婴幼儿是感染 RSV 的高危人群，且 RSV 感染无法产生永久性免疫，新生儿容易再次感染。
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症状难以区分：RSV 感染的前期症状主要是发烧、鼻塞、流涕等，与普通感冒类似，难以区分。如果从出现症状的第 4-5 天开始，患儿有明显的咳嗽伴喘息甚至憋喘，同时处于 RSV 感染高发季节，才高度提示患儿感染了 RSV，这可能导致早期诊断困难。
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存在严重并发症风险2：通常 RSV 感染病情较轻，有自限性，但新生儿或免疫功能低下者感染后可能会伴有严重并发症，如气管 - 支气管炎、病毒性心肌炎等，严重者可危及生命。