通过上述实验所构建的表达质粒pET-32a-His-APC10经限制性内切酶分析正确后,必须进行DNA序列测定,以获得序列完全正确的克...
2.利用末端转移酶和-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可...
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多...
2008年Mortazavi等人对小鼠的大脑、肝脏和骨骼肌进行了RNA 深度测序,这项工作展示了深度测序在转录组研究上的两大进展,表达计数和序列分析。对测得的每条序列进行计数获得每个特定转录本的表达量,是一种数码化的表达谱检测,能检测到丰度非常低的转录本。...
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可...
先进的基于焦磷酸测序(Pyrosequencing)的PSQ96 MA技术平台,能提供基于序列测定的SNP检测、等位基因频率分析和甲基化检测服务。另外,还提供短片段的测序服务(50-100 bp),适用于细菌和病毒分型等研究领域。 基于Pyrosequencing的SNP分析具有快速、高通量...
目前,Pyrosequencing技术被越来越多的应用于临床快速分子诊断,如通过Pyrosequencing技术检测 MTHFR编码基因的C677T位点的基因型,作为成年人冠心病和中风的辅助诊断手段;通过检测ApoE基因上的SNP112和SNP158,作为阿滋海默征的辅助诊断手段;对人基因组上1...
(2)输出:除了以文本形式外,还可以通过JalView显示和编辑结果。此外,还可以另外使用GeneDoc(常见于文献)及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。 3、ORF(Open Reading Frame)分析 从核酸序列翻译得到蛋白质序列,需要进行OR...
在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等,识别调控区的顺式...
核酸序列的一般分析流程 1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi 1.2.2 核酸序列的两两...