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术前评估：
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禁食禁饮：胃镜检查建议至少禁饮清水 2 小时、禁食 6 小时。对于胃排空障碍或急诊患者，麻醉医生应考虑选择适宜的镇静深度、判断检查是否应推迟以及是否需要气管内插管保护气道。
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病史采集：了解患者是否有打鼾、喘鸣及睡眠呼吸暂停，药物过敏，近期应用药物及药物相互作用，镇静或麻醉不良反应史，最后一次饮食的时间及种类，吸烟饮酒史等。
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身体检查：检查生命体征、心肺听诊，评估 ASA 分级、Mallampati 分级，所有生育年龄女性应检测是否妊娠。
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气道评估：存在既往镇静或麻醉并发症史、下颌异常（如小颌畸形、下颌退缩症、牙关紧闭及严重咬合不良等）的患者，气道管理可能较为困难。
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术中监测：术中镇静时，至少要监测并观察血氧饱和度、血压、通气状态、心电图及镇静深度。建议在术前、给予镇静药物后、术中至多间隔 5 分钟、苏醒时以及离室时进行监测。对于深度镇静的患者，应进行呼末二氧化碳波形监测，以降低风险。
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非镇静下胃肠镜检查：使用小口径内窥镜（＜6mm）进行的检查操作可在咽喉局麻下进行，不给予镇静药物。标准的非镇静下胃肠镜检查程序在术前应当建立静脉通路，以备患者不耐受需给予镇静药物或出现循环不稳定进行药物干预。
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轻中度镇静下胃肠镜检查：使用苯二氮卓类（如咪达唑仑和地西泮）、阿片类药物（如哌替啶和芬太尼）进行轻中度镇静下胃肠镜检查时，需要有经过培训的麻醉医师在场。麻醉医生应备好阿片类药物拮抗剂纳洛酮，苯二氮卓类药物拮抗剂氟马西尼。
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丙泊酚镇静下胃肠镜检查：
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非麻醉医师进行的丙泊酚镇静（NAAP）：NAAP 大多由通过培训的麻醉护士进行，术中需监护生命体征及给药，护士应具备紧急气道管理能力。但由于丙泊酚使用剂量的规定均由各个州、地区和地方制定，且无目标镇静水平的规定，因此在美国 NAAP 的应用有限。
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麻醉医师进行的丙泊酚镇静：需有经过专业教育和培训的医师团队，其中至少有 1 名医师掌握高级心肺复苏抢救技能。有专业医务人员术中全程监护患者的临床体征及生理参数，包括脉氧饱和度、心电图及血压等，必须备好适合不同年龄段的气道管理及复苏设备。在应用丙泊酚镇静期间麻醉医师不可离开，直至患者达到离室标准。
此外，指南还建议对所有拟接受镇静或麻醉下胃肠镜检查的患者进行术前评估，以确定可能出现的风险；对于无镇静相关风险的患者，建议使用阿片类药物联合苯二氮卓类药物达到轻中度镇静的状态；实施术中镇静的医护人员应接受内窥镜镇静治疗方面的专门培训，并具备诊断及处理与镇静相关不良事件的能力等。