《肝硬化患者粪菌移植治疗指南》由中国研究型医院学会肝病（中西医结合）专业委员会病毒性肝炎学组组织制定，旨在规范粪菌移植（FMT）治疗肝硬化的临床应用2。以下是该指南的部分要点2：
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开展机构与人员资质
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机构要求：FMT 应在有资质的三级甲等医院相应科室开展，具备 FMT 专用病房（床位 5 张以上）、低温储存设施、菌液加热与保温装置、二级生物安全防护实验室及相关实验设备。
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人员要求：开展 FMT 治疗的医师应具有《医师执业证书》，具有初级及以上专业技术职务任职资格，并经过药物临床试验规范（GCP）培训取得证书，接受至少 4 个月的系统培训，并在医师指导下参与 20 例以上 FMT 患者的全过程管理，经考核合格后取得资格证书。
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供体筛选与管理
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筛选标准：从生理、心理、个人及家族史、稳定性、持续性、限食耐受性等 6 个维度建立供体筛选标准。优先选择年龄小于 30 岁，最好是 18 - 24 岁、BMI 在 18.5 - 23.9kg/m² 内的健康成年人和青少年。
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管理措施：候选捐赠者应签署书面知情同意书，每次捐献粪便时均需填写问卷表。重复捐献粪便者，每 8 - 12 周需要重新体检。供体管理人员需与供体定期保持沟通交流，建立良好的信任关系，对供体的生活方式和饮食结构进行必要的管理和干预，及时纠正不良的生活方式和饮食结构，并根据随访结果及时剔除不合格供体。
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粪菌悬液制备
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粪便采集：供体粪便应使用特定一次性容器现场收集，采集至少 50g 粪便用于 FMT。
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制备方法：按照 1g 粪便加入 5mL 生理盐水的比例制备粪便悬液，使用自动净化系统的微过滤器制备洗涤菌群，向粪菌悬浮液中加入灭菌甘油，制备含 10% 甘油的粪菌液，避光保存。菌液制备后放置 - 80℃冰箱内保存，有效期为 6 个月。
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FMT 途径与操作
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途径选择：下消化道给药有禁忌时，选上消化道，剂量为 50 - 100ml；吞咽困难者不选上消化道途径。下消化道疗效好、风险低，首选结肠镜输入右结肠。
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操作要点：提前 24 小时停抗生素，首选无痛内镜，提前 24 小时肠道准备。冻存菌液 37℃水浴复温。
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疗程与随访
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疗程设置：结肠镜辅助 FMT，1 次 / 天，连续 6 天为 1 疗程，有改善再用胶囊巩固，间隔 4 周。不能接受结肠镜者可口服胶囊，6 粒 / 次、3 次 / 天，持续 2 周。特定情况可增加疗程。
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随访要求：所有受者都要随访，第一周评估疗效和不良事件，至少 4 周后评估主要结果。