百日咳是由百日咳鲍特菌引起的急性呼吸道传染病，曾是全球婴幼儿发病和死亡的重要原因。虽疫苗普及使其发病率下降，但近年来全球发病率呈上升趋势，中国也时有散发和局部流行，且因临床表现不典型及诊断手段局限，实际发病可能被低估。该指南的发布为临床提供规范指导，有助于提高百日咳的早期诊断率、规范治疗方案、降低并发症和死亡率，同时为公共卫生部门制定防控措施提供依据。
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病原学：百日咳鲍特菌是革兰氏阴性短小杆菌，需氧，无鞭毛和芽孢，对外界抵抗力弱。
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流行病学：患者和隐性感染者是主要传染源，潜伏期末至发病后 2 - 3 周传染性最强。通过飞沫传播，人群普遍易感，未接种或未全程接种疫苗的婴幼儿易感性高，冬春季多见，疫苗接种后流行特征改变，散发和局部流行常见。
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临床表现：潜伏期 7 - 14 天，典型经过分三期。卡他期类似上呼吸道感染，持续 1 - 2 周；痉咳期为阵发性、痉挛性咳嗽，持续 2 - 6 周或更长，咳嗽末有鸡鸣样吸气吼声，新生儿和婴幼儿可出现呼吸暂停等；恢复期痉咳逐渐减轻，持续 2 - 3 周。
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实验室检查：血常规在痉咳期白细胞计数升高，以淋巴细胞为主。病原学检查中，细菌培养是金标准，但耗时较长、条件要求高；核酸检测（PCR）快速、敏感、特异，适用于早期及抗生素治疗后患者。血清学检查主要用于回顾性诊断和流行病学调查。
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诊断与鉴别诊断：根据临床表现、流行病学史和实验室检查结果诊断，不典型病例依靠病原学或血清学确诊。需与支气管炎和肺炎、气管异物、咳嗽变异性哮喘等鉴别。
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治疗：
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一般治疗：按呼吸道传染病隔离，保持室内空气新鲜，给予营养丰富、易消化食物，补充维生素和钙剂，咳嗽剧烈者适当给予镇咳祛痰药物，但避免强力镇咳剂。
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抗菌治疗：早期用抗生素可减轻症状、缩短病程、降低传染性，首选大环内酯类抗生素，如红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等，对大环内酯类过敏者可选用复方磺胺甲噁唑等。
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对症治疗：痉咳严重者用支气管扩张剂雾化吸入或镇静剂；出现窒息、惊厥等并发症者立即抢救；并发肺炎者根据病原体选抗生素治疗。
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中医药治疗：可根据病情和体质辨证论治，选用中药方剂或中成药。
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预防：
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疫苗接种：是预防百日咳最有效措施。中国使用百白破联合疫苗（DTaP）和吸附无细胞百白破联合疫苗（IPV - DTaP），基础免疫在 3、4、5 月龄各接种 1 剂，间隔 4 - 6 周，加强免疫在 18 - 24 月龄接种 1 剂。
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控制传染源：及时隔离治疗百日咳患者，隔离期自发病之日起 40 天。