(一)治疗
治疗UTI要依据某些重要的临床药理学原理，合理应用抗生素。浅表黏膜感染如膀胱炎，尿路抗生素易达到有效浓度，即易治愈，血药浓度相对不那么重要。因此，青霉素不能用于尿路以外的大肠埃希杆菌和变形杆菌感染，而对由这些细菌引起的膀胱炎有效。同样，四环素在尿路可达有效抗菌浓度，在血清及组织中却不能，可用于治疗耐药的革兰阴性杆菌的感染，包括深部组织感染，肾脏、前列腺感染，同样感染的部位也需要有效的药物浓度。另外，有效血药浓度亦有益，主张用杀菌剂效果较抑菌剂好或两药联用，而不主张单个药物治疗。这些看法是否正确仍无定论，但在研究肾盂肾炎的实验模型中证实，立即减少肾内浓度与迅速得到有效抗菌治疗，对预防肾盂瘢痕形成同样重要，应特别的重视。
治疗UTI的目的是预防或治疗全身败血症，减轻症状，清除被隔离的感染灶，消除来自肠道及阴道菌群的尿路病原体，预防长期并发症，并应做到费用最低，副作用最少，耐药菌群产生的可能性最小。选择不同的药物治疗不同的UTI可获得达到上述目的最佳效果。常见尿路感染的治疗如下：
1.年轻女性的急性非复杂性膀胱炎 健康经产妇患有症状性下尿路感染(如排尿困难、尿频、尿急、夜尿、耻骨联合上区不适)，而无阴道炎的症状及体征(阴道分泌物臭味、外阴瘙痒、性交痛、只有排尿困难而无尿频及外阴阴道炎)者，其治疗应注意两点：
(1)清除下尿路浅表黏膜的感染。
(2)清除来自阴道及下消化道的尿路病原体。
为达此目的，可选用磺胺甲噁唑/甲氧苄啶(SMZ-TMP)或喹诺酮类的短程治疗，这两类药物均优于β-内酰胺酶。喹诺酮和甲氧苄啶(TMP)在阴道分泌物中浓度很高，超过清除常见的大肠埃希杆菌和其他主要尿感致病菌(肠球菌例外)的药物浓度。同时，这些抗生素的抗菌活性对那些能抵抗主要尿路病原体的厌氧菌群及微需氧菌群影响很小，这些菌群能保持完好。相反，β-内酰胺酶类药物，如阿莫西林，可促使尿路病原体大肠埃希杆菌在阴道中繁殖。
短程疗法有两种方案，即单剂量疗法及3天疗法，没有有力的证据证明3天疗法优于单剂量疗法。这两种方案，如选用磺胺甲噁唑/甲氧苄啶(SMZ-TMP)或一个喹诺酮类药物(环丙沙星、氧氟沙星、洛美沙星或诺氟沙星)，治疗女性膀胱炎时效果似乎差不多。但单剂量疗法清除来自阴道或肠道菌群的尿路病原菌时，疗效不如3天疗法好，其结果是早期复发，主要是因上述病原菌所致的复发更常见。健康经产妇女其症状提示膀胱炎时，要用更长的疗程(>5天)，这不仅费用高且副作用发生率高(皮疹、发热，尤其是使用磺胺甲噁唑/甲氧苄啶时胃肠不适)。阴道念珠菌感染时没有证据证明长疗程能提高这种特殊性UTI的治愈率。
值得强调的是，短程疗法尤其适宜于尿路表层黏膜感染，而对确有深部组织感染的患者(如女性隐性肾盂肾炎)往往需要更长的疗程才有效，短程疗法对他们可作为治疗的指导原则。短程疗法不能用于以下高度怀疑有深部组织感染的患者：男性UTI(不能排除前列腺内感染)、任何症状明显的肾盂肾炎、症状持续7天以上有潜在泌尿系结构功能异常的患者、免疫功能抑制者、留置导尿管或高度怀疑耐药菌感染者。
急性非复杂性UTI在其他方面健康的女性中，非常多见，致病菌范围亦很明确，对推荐使用的抗生素的敏感性也比较一致。短程疗法有效、副反应少、费用少，减少了实验室检查及就诊的需要。有排尿困难及尿频而不伴阴道炎的证据时，应及时开始短程疗法，如开始治疗前已留取了尿标本，则可作白细胞酯酶浸渍试验(报道敏感性为75%～96%)，不典型表现者应作尿培养和镜检。另外，有典型临床症状的患者，可以确诊的话，可不作尿液检查即开始短程治疗。这一疗法经济安全，大多可在无尿培养结果时根据典型表现开始进行，故费用少。
重要的是短程疗法完成后，医生对病情做出判断和处理。如无症状不需要再作任何处理，如仍有症状，则需进一步尿液分析和培养。如有症状而尿分析及培养结果阴性，没有明确的病原菌存在的依据时，则应注意个人卫生情况、是否内裤染料过敏及是否有妇科炎症的存在等等。如为脓尿而无菌尿，则应考虑有无衣原体尿道炎，尤其是在有多个性伴侣、性生活活跃的女性中。衣原体感染的最佳方案为：服用四环素或磺胺7～14天，性伴侣亦应予以同样的治疗。如患者仍为症状性菌尿且细菌对短程疗法方案中的抗生素敏感，那可能为肾内感染，应延长疗程至14天或更长，这时最有效的药物可能是喹诺酮和磺胺甲噁唑(TMP) 甲氧苄啶(SMZ)(如药物敏感)。