消化道肿瘤标准化生物样本库的建立与管理专家共识(2026 年版)
发布机构:江西省抗癌协会;发表期刊:《中华诊断学电子杂志》2026,14 (2),2026‑05‑26 发布。 适用:食管癌、胃癌、结直肠癌、肝胆胰肿瘤等消化道恶性肿瘤生物样本库;覆盖样本全生命周期:建设、采集、前处理、转运、储存、信息管理、质量控制、伦理审查、样本使用、共享、销毁,兼顾单中心与多中心样本库建设,兼顾手术标本、内镜活检、体液、粪便等消化道特有样本类型。
一、样本库基础设施与组织架构
1. 场地与硬件配置
1)分区设置:样本接收区、样本处理区、核酸提取区、低温储存区、质控检测区、信息机房、消毒消杀区;分区物理隔离,防止交叉污染。 2)储存设备:
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‑80℃超低温冰箱(组织、血浆、血清);液氮罐(细胞、类器官);2‑8℃短期暂存;石蜡档案库;
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全部设备配置不间断 UPS、温度 24h 实时监控、报警系统、异地备份告警;定期设备校验维护。 3)安全防护:生物安全二级(BSL‑2),处理肝炎、幽门螺杆菌等消化道高感染风险样本;配置生物安全柜、个人防护、废弃物处置流程。
2. 组织与 SOP 体系
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设立样本库负责人、实验技术人员、病理质控专员、信息管理员、伦理联络员;多学科协作:病理科、消化内科、胃肠外科、检验科、信息科、伦理委员会。
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必须建立全套标准化操作规程 SOP:采集、接收、处理、分装、储存、质控、样本出库、销毁、应急处置;定期培训、考核、版本更新。
二、样本类型、采集与时间窗(消化道肿瘤重点)
原则:临床病理诊断优先,只有诊断剩余标本才可用于样本库科研收集。
1. 组织类样本
1)手术切除标本(肿瘤组织、癌旁正常组织、远隔正常组织、转移淋巴结)
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缺血时间(离体至冻存):RNA 研究≤15 min;DNA 研究≤30 min,全程记录缺血时间;剔除坏死、出血、纤维化区域;样本块 0.2‑0.5 g;一部分速冻‑80℃,一部分石蜡包埋。 2)内镜活检标本(胃镜 / 肠镜活检) 消化道特有重点:活检组织体积小,优先速冻‑80℃,也可固定石蜡包埋;记录活检部位、取材数量;避免福尔马林浸泡后再用于核酸提取。
2. 体液类样本
1)外周血:空腹采集;分离血清、血浆、PBMC;分装多管‑80℃保存;配套 EDTA 全血(胚系对照 DNA)。 2)腹水、胆汁、胰液:消化道特有体液样本;尽快处理分装冻存,注意感染风险。 3)粪便样本(消化道肿瘤特色):采集后快速分装,‑80℃冻存;避免反复冻融;用于肠道微生物组研究。
3. 配套临床信息采集(必填字段)
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基本信息:匿名化样本编号,不直接留存身份证;
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临床:肿瘤部位、TNM 分期、分化、病理亚型、MMR/MSI、HER2、分子检测结果;治疗史(手术、化疗、靶向、免疫);随访:OS、DFS、复发转移时间;
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样本元数据:离体缺血时间、采集方式、储存条件、冻融次数。
三、样本前处理、转运与分装
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分装原则:多管小份分装,减少后续反复冻融;每管标注唯一样本编码,禁止使用患者姓名住院号直接标记冻存管。
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转运:干冰转运‑80℃样本;2‑8℃用于短期运输;全程温度监控记录;感染性样本按生物安全包装运输。
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粪便、胆汁、腹水样本:操作在生物安全柜完成,做好生物危害防护。
四、样本储存管理
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冻存管理:建立位置映射表,每支样本唯一编码、库位可追溯;出入库全程记录台账。
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冻融管控:严格控制冻融次数,优先小份分装;每一次解冻记录冻融次数。
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石蜡样本:阴凉干燥档案库房长期保存。
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应急预案:冰箱故障、停电、液氮不足,制定样本转移应急 SOP。
五、质量控制 QC(共识核心)
1. 组织样本质控
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病理质控:HE 染色评估肿瘤细胞占比,记录肿瘤细胞百分比;坏死占比过高样本标记降级使用。
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核酸质控:RNA‑RIN 值,DNA‑OD、浓度;RIN≥6 为 RNA 合格阈值;不合格样本标注,限制下游研究用途。
2. 体液、粪便质控
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血浆 / 血清:溶血程度记录;粪便样本避免粪便降解、微生物污染质控。
3. 定期库内抽检
每季度随机抽检库存样本质量;定期校验储存设备、温度日志。
六、信息系统管理
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样本库信息系统:实现样本编码、库位、临床随访、质控结果、出入库全流程可追溯。
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隐私保护:去标识化处理,分离样本编码与患者原始身份信息;数据加密,权限分级管理。
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多中心样本库:统一元数据字段标准,便于跨中心数据交换;遵循人类遗传资源数据管理要求。
七、伦理、知情同意与人类遗传资源合规(强制要求)
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伦理委员会审批:样本库建设项目必须先过伦理审查;定期复审。
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知情同意:书面知情同意;告知样本用途、储存期限、样本销毁权利、隐私保护;提供受试者随时撤回同意的途径。
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人类遗传资源法规:对外合作、出境样本,严格按照《人类遗传资源管理条例》完成申报审批,严禁未经审批出境人源样本 / 数据中国政府网。
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感染性样本(乙肝、丙肝、幽门螺杆菌阳性标本)做好风险标记,生物安全管理。
八、样本申请使用、共享、销毁
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样本使用申请:项目伦理审批→申请评审委员会评估→出库;记录使用去向。
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多中心共享:统一标准,签署共享协议;去标识化,遵守遗传资源管理。
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样本销毁:受试者撤回知情、项目结束、样本质量失效;按生物废弃物规范销毁,留存销毁记录。
九、消化道肿瘤样本库特有注意要点(2026 版新增重点)
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内镜活检样本体积微小,质量损耗风险高,严格控制离体时间。
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粪便、胆汁、腹水等特殊样本,微生物、蛋白酶丰富,处理时间要求严格。
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重视配对样本:肿瘤‑癌旁‑外周血胚系‑粪便的成套样本收集,适合消化道肿瘤微生物、液体活检研究。
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区分回顾性旧样本库(回顾收集既往剩余标本)与前瞻性新建样本库,二者知情同意要求不同。
十、共识核心速记(MDT / 实验室速用)
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消化道肿瘤样本库包含手术组织、内镜活检、血液、腹水、胆汁、粪便等特有样本;病理诊断优先原则。
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组织离体缺血时间严格管控:RNA 研究≤15 min,DNA 研究≤30 min,完整记录。
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小份多管分装,严控冻融次数;病理评估肿瘤细胞占比,核酸做 RIN/DNA 质控。
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全流程伦理审查、书面知情同意、去标识化隐私保护;严格遵守人类遗传资源管理条例。
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设备 24h 温度监控、UPS 保障;建立完整 SOP、出入库台账、应急处置。
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样本使用需要项目伦理审批;受试者有权撤回同意,样本按流程销毁留存记录。
备注:以上为专家共识学习整理,不替代原文,不作为实验室执行依据,实际建设请查阅《中华诊断学电子杂志》原版全文执行