大约50%(30%-60%)的急性HCV感染者将演变为病毒的持续携带态。由于其存在病毒血症因而可成为重要的传染源。慢性丙型肝炎包括慢性迁延性肝炎和慢性活动性肝炎，可由急性肝炎演变而，也可隐匿发病。与乙型肝炎相比，丙型肝炎具有更强的慢性化倾向，约有20%的慢性丙型肝炎患者将在20-30年内发展为肝硬变，这些患者在未来10年内可发展为肝癌。
庚型肝炎可与其他肝炎病毒联合感染，其中以合并HBV、HCV 感染者居多。据统计在成年慢性乙肝和丙肝患者中分别有10%-20%的人同时感染GBV-C/ HGV。在我国，有调查表明，临床乙肝、丙肝、非甲戊型肝炎中GBV-C/ HGV 的感染率分别为9%、10%和17%。虽然GBV-C/ HGV 能够引起慢性感染和病毒血症，但很少引起肝细胞的炎症，而且大多数感染的人都没有症状，ALT水平通常是正常的。