一、实验目的 掌握植物cDNA合成的原理和方法 二、实验原理 反转录酶主要用于体外cDNA的合成。目前最常用的反转录酶(reverse transcriptase) 有SuperscriptII、M-MLV和AMV等。它们具有依赖于RNA或DNA的DNA聚合酶活性和RNaseH酶活性,可以以RNA分子为模板,合成...
[实验原理] 总RNA,经寡聚(d丁)纤维素亲和层析柱分离出mRNA,以寡聚(d丁)为引物,经反转录合成双链cDNA。先用反转录酶合成第一条cDNA链;经碱降解作用除去RNA模板后用大肠杆菌DNA聚合酶,以第一条链cDNA的3末端结构为引物合成第二链,最后形成双链cDNA。 [仪...
2. 电泳分析 (1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳, 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。 (2) 取样品液, 用TE调整体积, 使第一链和第二链产率测定液的体积相同,加入等体积的2样品缓冲液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉兰)。 (3) 加样,电...
3. 第一链产量测定 第一链掺入率(%)= 掺入cpm/总cpm 100% 掺入dNTP(nmol)=2nmol dNTP/l 反应体积(l)(第一链掺入率) 设330为每mol dNTP的平均分子量 合成cDNA量(ng)=掺入dNTP (nmol)330ng/nmol mRNA向cDNA转变率=合成cDNA量(ng) / 模板RNA量(ng)100% 例如总放...
Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成,最后用T4 DNA聚合...
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响,至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置,但这个过程十分耗时且昂贵,不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3-4对siRNAs,实验选择较有效...
体外制备 1.化学合成 许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高,定制周期长,特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高,为一个基因合成3―4对siRNAs 的成本就更高了,比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列...
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。 RNA干涉(RNAi)在实验室中是一种强大的实验工具,利用具有同源性的双链...
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。 microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3UTR区域结合来...
1. 希望软件可以在 web 上使用。 即用户可以访问我们的网站, 输入基因代码, 即可自行在网上设计 siRNA Oligo 。 2. 可参照的软件形式: 见如下网站: www.dharmacon.com www.ambion.com www.qiagen.com 3. 希望能就每一个所指定的基因找到至少四对以上可...