2015 年世界过敏组织（WAO）发布的《过敏性疾病预防指南：益生菌》指出：
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目前使用益生菌预防儿童过敏疾病的证据不足，但对于有过敏家族史的孕妇妊娠后期使用益生菌、过敏高风险婴儿的母亲哺乳期使用益生菌以及过敏高风险婴儿生后即刻使用益生菌等情况，可能会有获益。
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基于对单一益生菌或混合益生菌治疗的研究荟萃分析显示，有过敏性疾病家族史的孕妇使用益生菌预防治疗，可能有助于预防儿童湿疹。
总体而言，WAO 指南认为虽然现有证据不能明确补充益生菌可降低儿童发生过敏的风险，但在特定高风险人群中使用益生菌可能存在净收益，不过这些建议都属于有条件推荐，证据质量非常低。