按1999年WHO分类标准：
A型胸腺瘤：即髓质型或梭型细胞胸腺瘤。
AB型胸腺瘤：即上皮细胞、淋巴细胞混合型胸腺瘤。
B型胸腺瘤：被分为3个亚型；B1型胸腺瘤：即富含淋巴细胞的胸腺瘤、淋巴细胞型胸腺瘤、皮质为主型胸腺瘤或类器官胸腺瘤；B2型胸腺瘤：即皮质型胸腺瘤；B3型胸腺瘤：即上皮型、非典型、类鳞状上皮胸腺瘤或分化好的胸腺癌。
C型胸腺瘤：即胸腺癌，组织学上此型较其他类型的胸腺瘤更具有恶性特征。A型和AB型为良性，B型和C型为恶性。简化分类：胸腺瘤（A、AB、B1、B2）、不典型胸腺瘤（B3）、胸腺癌（C）
这一组织学分类更多的应用于临床，在治疗模式的选择上起着指导性的作用。
胸腺瘤的手术切口是怎么选取的？
⑴颈部：颈部切口简单，并发症较少，但不易达到完整切除的目的。
⑵经正中全劈胸骨或部分胸骨劈开切口：具有视野开阔、显露好的特点，能彻底清除胸腺组织及前纵隔脂肪，对前位双侧性肿瘤，特别是较大肿瘤、侵袭性胸腺瘤及合并重症肌无力者非常适用。另外，由于该入路可以充分显露整个前纵隔，便于施行扩大胸腺切除术，而且一旦发生大血管损伤，可迅速控制处理。根据术前CT片定位选择肿瘤偏少的一侧偏正中劈开胸骨切口较多用(必要时可向锁骨上延长或横断胸骨)。
⑶前外侧切口：前外侧切口及腋下小切口具有生理干扰小的优点，可达到较好显露，但彻底清除胸腺组织及前纵隔脂肪较困难，对于胸腺瘤合并重症肌无力者不宜选用。
⑷后外侧切口：显露好，能彻底清除胸腺组织及前纵隔脂肪，但手术创伤大，适用于术前诊断不明确或纵隔内器官、组织受累者。
⑸胸腔镜辅助下微创治疗。如果纵隔占位比较小，胸部CT显示与周围组织器官界限清晰，容易分离，可以尝试微创手术治疗。