头孢哌酮舒巴坦用药中如出现严重的过敏反应，应立即停药，必要时须给予肾上腺素急救及给氧、静脉给予皮质激素、气管插管、机械通气等救治\ 措施。
用药期间及停药后5d内禁止饮酒，也禁用含乙醇成分的药物或食物，以避免出现双硫仑反应。严重胆管梗阻者、严重肝疾病者、肾功能障碍同时存在肝功能;不全者、维生素K缺乏、营养不良、吸收障碍者慎用。
本药已被有效地用于婴儿感染的治疗,但尚缺乏对早产儿和新生儿用药安全性和有效性的研究，因此，新生儿和早产儿用药须权衡利弊。老年人呈生理性的肝、肾功能减退，因此应慎用并需调整剂量。
孕妇仅在确有必要时才能使用本药，美国食品药品管理局对本药的妊娠安全性分级为B级。哺乳期妇女应慎用。
对使用头孢哌酮舒巴坦时间较长者，应定期检查肝、肾功能及血常规、凝血酶原时间。对诊断的干扰，直接抗球蛋白实验(Coombs实验)呈阳性反应；铜还原试验测定尿糖时可呈现假阳性。