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病史：有进行性加重的继发性痛经病史，或有不孕史，或有剖宫产、人工流产等手术史。
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症状：存在痛经（继发性，进行性加重）、慢性盆腔痛、深部性交痛、肛门坠痛、排便痛等，疼痛程度与病灶大小不一定成正比。
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影像学检查：盆腔超声、CT 及 MRI 等可发现内异症病灶或未见异常。
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实验室检查：血清糖类抗原 125（CA125）水平可能升高，重症患者更为明显，但其诊断内异症的敏感性和特异性均较低。
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腹腔镜检查：是内异症的手术诊断方法，可以对病变部位及范围进行探查，并能获得病变组织以进行组织病理学诊断。
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疼痛程度评分：采用视觉模拟量表（VAS）评分法，轻度疼痛 1-3 分；中度疼痛 4-6 分；重度疼痛 7-10 分。
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寒凝血瘀证：经前或经期小腹冷痛拒按，得热痛减，或伴非经期小腹疼痛，或伴性交痛。月经量少或延后，色黯有块，形寒肢冷，便溏，盆腔有结节或包块。舌紫黯，或有瘀点瘀斑，苔薄白或白腻，脉沉紧或弦。
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气滞血瘀证：经前或经期小腹胀痛拒按，胸胁、乳房胀痛，经行不畅，经色紫黯有块，块下痛减，盆腔有结节或包块。舌紫黯或有瘀点瘀斑，脉弦涩。
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湿热瘀阻证：经前或经期小腹疼痛或胀痛，痛连腰骶，或平时小腹痛，经行加剧，发热，月经量多，色红质稠，有血块，带下量多，色黄质稠，盆腔有结节或包块。舌红，苔黄腻，脉滑数或弦数。
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肾虚血瘀证：经行或经后小腹隐痛，腰膝酸软，头晕耳鸣，月经量少，色淡黯，或有血块，盆腔有结节或包块。舌淡黯，或有瘀点瘀斑，脉沉细或沉涩。
根据患者的年龄、病情轻重，综合评估，个体化治疗。以活血化瘀止痛为主，遵循 “急则治其标，缓则治其本” 的原则，经期活血祛瘀，行气止痛；非经期针对病因，调节脏腑功能。药物治疗过程中需评估疼痛程度的变化，药物治疗无效可中西医结合或考虑手术治疗。
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气滞血瘀证：治法为理气活血，化瘀止痛。推荐膈下逐瘀汤（《医林改错》）加减治疗。若症见胸胁刺痛、急躁易怒、夜寐不安者可选用血府逐瘀汤（《医林改错》）加减治疗。
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寒凝血瘀证：治法为温经散寒，化瘀止痛。推荐少腹逐瘀汤（《医林改错》）加减治疗。
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湿热瘀阻证：治法为清热利湿，化瘀止痛。推荐四妙勇安汤（《验方新编》）合桂枝茯苓丸（《金匮要略》）加减治疗。
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肾虚血瘀证：治法为补肾活血，化瘀止痛。推荐右归丸（《景岳全书》）合失笑散（《太平惠民和剂局方》）加减治疗。