脂肪肝的诊断标准主要依靠病史、临床表现、实验室检查，特别是B超和CT检查，但确切的诊断仍依赖于肝活检。
(1)病史、临床表现
脂肪肝的诊断常不容易确立，有下列病史对诊断有一定帮助。
①过去史中有前述引起脂肪肝的原因者。如酒精性脂肪肝有长期酗酒史，尤其是酒精成分高的白酒。肥胖、糖尿病、静脉高能营养、使用有关yao物及接触毒物都有各自的临床症状和体征，容易区别。
②有难以用其他原因解释的上消化道症状者(应做胃镜检查是否存在慢性胃炎等)及排除胃神经官能症者。
③肝脏肿大，平，滑，软，边缘钝圆，无明显压痛，且无其他确定肝病者。
④排除慢性病毒性肝炎、血吸虫肝、肝寄生虫等肝脏疾病。
(2)实验室检查
①血清谷草转氨酶、谷丙转氨酶、胆碱酯酶、碱性磷酸酶轻度增高，但这些均为非特异性变化(即不一定为脂肪肝，也可以为其他肝病所有的化验异常)。②血浆球蛋白常有变化，蛋白电泳检查，特别是α1-、α2-及β-球蛋白有增高，血胆红素增高仅见于脂肪肝伴胆汁淤积者。③有高脂血症。即血中甘油三酯、总胆固醇、β-脂蛋白可有明显升高。
(3)影像学检查及其他检查
B型超声、CT、MRI检查对确诊有很大价值。
肝活检是确诊脂肪肝的主要方法。在光学显微镜下，肝细胞内、外脂肪浸润;电子显微镜下观察，实验室脂肪肝的改变可出现中性脂肪堆积在线粒体或其他细胞器中。