1.骨形成指标
(1)血清骨源性碱性磷酸酶(bALP)：该酶由成骨细胞合成与分泌，它在血液中的浓度可反映成骨细胞水平，对bALP活性的监测及动态观察将为疾病的早期诊断，治疗效果的监测，病情预后等提供有效依据。
(2)骨钙蛋白(BGP)：骨钙蛋白又称骨钙素，它来自成骨细胞的非胶蛋白，半寿期为5min，监测血BGP不仅能反应成骨细胞活性而且可以帮助观察药物治疗后成骨细胞的改变，当骨形成与骨吸收耦联时，骨钙素是反映骨形成的特异指标，在许多内分泌疾病和骨病患者中，血清骨钙素发生变化，是临床上诊断，检测病情的一项重要生化指标，可直接反应骨形成速率，抗骨吸收药物可使BGP水平下降，而刺激骨形成治疗则使BGP水平上升。
(3)原胶原延长肽(PICP)：该肽力为在Ⅰ型胶原蛋白修饰过程中被切下而排出体外的一段多肽，其水平高低能够反映成骨细胞的胶原合成功能。
2.骨吸收指标
(1)空腹尿钙/肌酐比值：正常值为0.13±0.01，如尿钙排出量增加，说明骨吸收率增加，骨吸收时，骨钙释放入血，导致尿钙升高，由于影响尿钙的因素较多，因此特异性不强。
(2)空腹尿羟脯氨酸/肌酐比值：正常高限为0.016，比值增高，说明骨吸收率增加，虽较常用，但特异性及敏感性均不强。
(3)抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)：主要存在于破骨细胞，其水平可反映骨质吸收情况，绝经妇女，甲旁亢和甲亢患者血清TRAP显著增加，绝经后妇女接受雌激素替代疗法后，血清TRAP下降70%，是反映破骨细胞活性的较好指标。
(4)Ⅰ型胶原吡啶交联物及末端肽：作为骨吸收指标近年来受到重视，有较强的特异性与代表性。
骨转换标志物排泌有昼夜节律，这提示我们在收集标本时要定点标准化。
3.骨密度测定方法
单光子吸收法(SPA)，双光子吸收法(DPA)，定量CT法(QCT)，定量超声测定法(QUS)，双能X射线骨密度测定法(DEXA)等，以测定骨质疏松的程度，确定诊断及检查药物治疗的效果，其中以双能X线骨密度测定仪较好，是目前公认的骨质疏松检查的金标准，与QCT相比，具有价格低廉，结果确切灵敏度与正确度均高的优点，在20世纪70年代发展了双光子技术，即用两种不同能量的射线校准不同软组织厚度及脂肪含量，双光子很快就被双能X线所取代，并得到广泛使用，两者的工作原理一样，但DXA比DPA扫描快，更精确，更准确，避免了同位素的衰减，它的原理是两种能量X线同时穿过身体，被探测器接收，因不同组织(主要是骨，脂肪和肌肉)对高低两种能量X线的反应不同，因此可以用数学公式校正，不同的厂家采用不同的技术得到两种能量X线，一种是用K边缘过滤，另一种是使用转换开关。
4.临床应用
(1)诊断骨质疏松：现在有多种测量方法可用于诊断骨密度降低，在选择测量方法和部位时，有两个问题需要考虑：身体各个部位骨骼的骨密度不一致，在某些部位骨密度可假性升高，各部位骨骼的骨密度不是均匀一致，每个人脊柱，髋和腕部的相对骨密度不同，这种不一致性在绝经后早期比老年妇女更明显，可能与在绝经后早期松质骨的转换率和骨丢失率比老年妇女高有关，也正因为如此，在早期绝经后妇女以DXA或QCT测量腰腿骨密度诊断骨质疏松的比例要比测量腕部或髋部高，为了避免漏诊，理想的应该是测量一个部位以上。
65岁以后，骨密度的不一致性减弱，可根据髋部或四肢部位的骨密度来诊断骨质疏松，因为在老年人腰椎退变很常见，而退变引起的骨赘，骨硬化可使骨密度假升高。
(2)预测骨折：在决定适当的测量方法和解释骨密度结果时，病人的年龄要考虑在内，绝大部分骨密度预测骨折危险性的研究集中在65岁以上的妇女，很少研究围绝经期人群，因此，1名70岁妇女在某一骨密度值的相对骨折危险性不能引用到50岁的妇女，年龄本身是一个独立的预测骨折的危险因子。
(3)监测骨密度随时间的变化：骨密度测量可用于监测骨老化。