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RT-PCR原理与实验操作步骤-3

作者:中华医学网发布时间:2017-10-14 20:02浏览:

八、PCR产物电泳

先将1-10μl左右PCR产物,加已点在纸上的溴酸兰,反复吸打混匀后进行电泳,一般电流为10mA,电源100V,电泳30分钟,紫外灯下观察,满意的结果扫描打印。

九、几个注意点:

1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴?

2、Rt时,先打开PCR预热30分钟。

3、RNA抽提前,打开离心机预冷。

TRIzol法抽提总RNA

细胞1×107

组织100mg



加1mlTRIzol

细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块



匀浆(要彻底,后转至EP管)

(组织匀浆量>100mg时分装1ml/每EP管)



颠倒混匀10下,室温5分钟



加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)



颠倒混匀10下,室温5分钟



4℃,离心12000g,15分钟



转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中



加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟



4℃,离心12000g,10分钟



弃上清



加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml



4℃离心7500g,5分钟



弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥)



溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl)

(可在55-60℃水中,<10分钟助溶)

注:

1、RNA若用于核酸转移应溶解于样本缓冲液中,否则DEPC溶解

2、细胞组织加TRIzol匀浆后,可在-60℃放置至少一个月(甚至可一年以上)

3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年


两步法RT-PCR

(第一步:逆转录反应)

试剂 浓度 体积 终浓度

RNA 23μl(11.5μl)

Oligo(dT)15 0.05μg/μl 4μl(2μl) 0.005μg/μl

(稀释10倍后用)



混匀,离心,70℃ 5min



立即冰水浴,稍离心



试剂 浓度 体积 终浓度

M-MLV Buffer 5× 8μl (4μl) 1×

dNTP 10mM 2μl (1μl) 0.5mM

RNasin 40U/μl 1μl (0.5μl) 20μ

M-MLV 200U/μl 2μl (1μl) 200U

总体积40μl(20μl)



混匀,离心,42℃ 60min



95℃ 10min(破坏MLV)



4℃保存

两步法RT-PCR

(第二步:PCR反应)

总体积20μl(50μl)

试剂 浓度 体积 终浓度

Taq Buffer 10× 2μl (5μl_) 1×

MgCl2 25mM 1.2μl (3μl) 1.5mM

dNTP 10mM 0.2μl (0.5μl) <200uM

上游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

下游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol

cDNA模板 X (?) (1-10μl)

DEPC水 20μl-4.3μl-X