虹膜囊肿的病因有多种，包括先天性、外伤植入性、炎症渗出性和寄生虫性等。其中以外伤植入性最常见。是由于眼球穿通伤或内眼手术后，结膜或角膜上皮通过伤口进入前房，种植于虹膜并不断增生所致。
目前多采用激光和手术治疗。
1、本疾病应及早手术，手术时将囊肿连同受累的虹膜组织一并切除。手术时角巩膜缘切口不应过小，以便充分暴露囊肿，彻底清除并减少损伤晶体的危险。
2、如囊肿较大，累及范围较广时，则可考虑局部手术切除术合并激光疗法或放射疗法。以便清除或抑制残存的囊壁组织，免其复发。
眼科检查。前房角镜检查，虹膜检查，眼球和眼眶的超声检查，眼功能检查等检查。
虹膜囊肿可向后房伸展，于瞳孔区见到虹膜后有黑色隆起块，易被误诊为黑色素瘤。
本疾病应及早手术，手术时将囊肿连同受累的虹膜组织一并切除。手术时角巩膜缘切口不应过小，以便充分暴露囊肿，彻底清除并减少损伤晶体的危险。
当囊肿增大占据前房或堵塞房角时，可引起难以控制的青光眼。