常见的检查方法有以上几项，前三项初诊时必须检查，后两项根据情况选用。
（1）肛门视诊：也就是观察肛门局部外观情况，一般包括以下几点。①观察肛门是否有移位或变形。②观察肛周皮肤是否润泽、颜色有无异常，皮肤是否粗糙，有无糜烂、有无抓痕等。③肛门处有无肿物并注意其大小、位置、形态、颜色及有无根蒂。④肛周有无污染物，如血迹、脓液、渗液、粪便等。
（2）肛门指诊：也就是医生戴手套先在食指端涂少许润滑剂，将手指缓慢插入肛管。检查肛管及直肠内有无病变。检查的重点：①肛门括约肌的松紧度。②肛门、肛管和直肠是否有狭窄。③肛管内是否有压痛点。④肛管直肠内是否有凹陷、硬结、隆起和肿物，如有的话触摸其软硬、光滑与否、活动度及其部位。⑤退出手指后观察指套上是否带有血液、脓液及黏液等。
（3）肛门镜检查：肛门镜是一种医疗检查设备，现在一般多是一次性使用，涂以润滑油后缓慢插入肛门内，可以看到肛管及直肠末端的情况。观察黏膜颜色、充血和水肿，有无糜烂、溃疡、息肉、肿瘤、狭窄和异物。再将窥器向外慢慢拉出，仔细观察，在齿线附近可检查内痔、肛乳头、肛窦和肛瘘内口。
（4）乙状结肠镜检查：一般指是直筒形，长20~25厘米，有一次性使用的，有反复使用的，有电子乙状镜，也就是通过显示屏观看的，也有的直接目镜观察的。虽然叫做乙状结肠镜，但往往不能达乙状结肠或只到达一部分乙状结肠。一般直肠的全长是能观察到的，因为直肠是癌的多发部分，所说本项检查非常必要，而且操作简单方便，无需特殊准备，患者痛苦也小，是临床上非常用的检查方法。通过乙状结肠镜检查，可以发现可视范围内黏膜的病变，如炎症、溃疡、息肉、肿瘤等。
（5）电子结肠镜检查：电子结肠镜包括全结肠镜和乙状结肠镜，一般指的是全结肠镜，能够到达回盲部，观察整个大肠的病变，检查前需要肠道准备，食无渣饮食3天，术前服用泻药以排空肠腔粪便，所用泻药根据患者有一定的腹痛、腹胀等不适症状，但一般均能耐受，由于每个人结肠的走行、长短不同，患者的自觉痛苦程度也不同。有的医院一切展无痛结肠结肠镜检查，即患者在全麻下进行检查，因全麻本身了有一定的危害，而且由于全麻后患者无疼痛，不能配合医生，也引起并发症的出现，所以无痛结肠镜检查不宜提倡