一、肛周脓肿可以通过感染而发病，如一些病原菌的感染。还有一些医源性因素也可引起疾病，如患者在治疗痔疮时因为注射药物或操作不当而引起的药物不洁引起的肛周脓肿的粘膜感染。
二、肛周脓肿的病因包括手术，如肛门直肠手术感染可导致手术如尿道后，患者的直肠周围脓肿形成，会阴部手术后感染以及女性在生产运行过程中都可以引起本病。
三、肛周脓肿也可由其他因素引起的，如直肠里面的异物损伤引起的感染造成了人的直肠，某些放线菌感染，直肠憩室炎感染。这些感染也可引起肛周脓肿。有些肿瘤，如直肠癌，也可能导致疾病。
需要注意一点就是不一定感染之后就一定会发生肛周脓肿，感染而发病一般是针对身体抵抗能力比较差的人，如果身体抵抗能力强，被感染之后也可能不发病