由于肠道疾病种类颇多，而且临床症状多相似，主要以腹泻为主。如果单凭临床症状可能无法评估病情的程度以及肠道病变的位置，因而，为了进一步明确是否为慢性结肠炎，临床常采取如下检查方式进行检查确诊。
检查方式
血液检查：
血红蛋白在轻型病例多正常或轻度下降，中、重型病例有轻或中度下降，甚至重度下降。白计数在活动期可有增高。血沉加快和C_反应蛋白增高是活动期的标志。严重病例血清白蛋白下降。
粪便检查：
粪便常规检查肉眼观常有黏液脓血，显微镜检见红和脓，急性发作期可见巨噬。粪便病原学检查的目的是要排除感染性结肠炎，是本病诊断的一个重要步骤，需反复多次进行（至少连续3次）。
结肠镜检查：
该检查是本病诊断与鉴别诊断的最重要手段之一。应作全结肠及回肠末段检查，直接观察肠黏膜变化，取活组织检查，并确定病变范围。
胃肠疾病常常引发消化道发生病变，对人体危害严重，胃癌、肠癌等等疾病的初期都是由此而来。因此患病要积极接受治疗。