作者:中华医学网
发布时间:2017-10-15 19:07浏览:
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(2)引物:
引物 |
序列(5’~3’) |
位置 |
片段(bp) |
逆转录引物 |
TAGTAGTAGACTCC |
1~14 |
LMS |
通用外引物 |
AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG |
1910~1939 |
M(+) |
|
GTACAICCTGTRCCIACCCC |
2373~2354 |
M(-) |
型特异性引物 |
|
|
|
汉滩病毒 |
GAATCGATACTGTGGGCTGCAAGTGC |
1958~1984 |
M(+) |
|
GGATTAGAACCCCAGCTCGTCTC |
2318~2340 |
M(-) |
汉城病毒 |
GTGGACTCTTCTTCTCATTATT |
1936~1957 |
M(+) |
|
TGGGCAATCTGGGGGGTTGCATG |
2331~2353 |
M(-) |
S片段引物 |
ATGTTGCCTGGGGIAAAGAGG |
1200~1220 |
S(+) |
|
GCGCACTAGTAGTAGTAGACTCCCTAAAGA |
1670~1696 |
S(-) |
方法:
1)病毒RNA的提取:采用TRIzol按说明提取,制备模板RNA;
(2)逆转录、合成cDNA:采用 SuperScripTMII或AMV逆转录酶,按说明书进行;
(3)PCR扩增:反应条件为95℃预变性10分钟,94℃60秒、55℃60 秒、72℃45秒、扩增30~35个循环,72℃延伸12分钟。
(4)扩增产物用1~2%琼脂糖凝胶电泳鉴定。若条带的分子量与预期片段大小相同,则表明为特异性扩增产物。
必要时,可进行:
(5)PCR片段的回收和核苷酸序列测定:切下特异分子量条带,用QIAquick凝胶回收试剂盒回收(按其说明书进行),自动测序仪测序。
意义:扩增到特异性条带可确诊汉坦病毒并明确其型别,序列测定还可以对汉坦病毒的变异情况进行研究。