本病无特效疗法，以对症治疗为主。暂停乳类及双糖类食物。吐泻较重时用止吐剂及镇静剂。口服或静脉补液以纠正和电解质紊乱。
西药药物：
(1)柳氮磺胺吡碇(SASP)。本药在肠道内分解为5-氨基水杨酸(5-ASA)与碘胺吡碇，前者是主要有效成分，能抑制黄嘌呤氧化酶或白细胞介导的氧自由基形成，能消除炎症。
(2)甲硝唑。主要用于各种厌氧菌感染、阿米巴病及丝虫病等。
(3)激素类。具体药物有氢化可的松、强的松、地塞米松等。
(4)硫唑嘌呤 。此类药物在体内产生硫嘌呤而发挥免疫抑制作用，抑制蛋白质的合成和淋巴细胞的增殖，对T淋巴细胞的抑制作用较强。
中药辩证疗法。经由效灵清肠方三步清肠，第一步以清肠道之毒，第二步以复肠道之功能，第三步以强肠道之免疫。通调全身，巩固疗效防止复发。