(一)治疗
如果临床确诊或高度怀疑为疟疾，在检查完呼吸道和称完体重后，就应开始抗疟疾治疗。如果存在，或不能排除低血糖，应按低血糖给予治疗，如果存在呼吸窘迫或低血氧，应给予吸氧。如果脱水即应补液。如果确诊或高度怀疑为重症疟疾，应将患者转入ICU。
1.基础治疗
(1)发作期及退热后24h应卧床休息。
(2)要注意水分的补给，对食欲不佳者给予流质或半流质饮食，至恢复期给高蛋白饮食;吐泻不能进食者，则适当补液;有贫血者可辅以铁剂。
(3)寒战时注意保暖，大汗应及时用干毛巾或温湿毛巾擦干，并随时更换汗湿的衣被，以免受凉;高热时采用物理降温，过高热患者因高热难忍可药物降温;凶险发热者应严密观察病情，及时发现生命体征的变化，详细记录出入量，做好基础护理。
(4)按虫媒传染病做好隔离。患者所用的注射器要洗净消毒。
2.病原治疗 病原治疗的目的是既要杀灭红内期的疟原虫以控制发作，又要杀灭红外期的疟原虫以防止复发，并要杀灭配子体以防止传播。
(1)控制发作
①氯喹(磷酸氯喹)：每片0.25g(基质0.15g)。第1天4片，6h后再服2片，第2、3天每天2片，共计10片。治疗间日疟及三日疟第1天4片已足;治疗半免疫者单剂4片即可。该药吸收快且安全，服后1～2h血浓度即达高峰;半衰期120h;疗程短;毒性较小，是目前控制发作的首选药。部分患者服后有头晕、恶心。过量可引起心脏房室传导阻滞、心率紊乱、血压下降。禁忌不稀释静注及儿童肌内注射。尿的酸化可促进其排泄。严重中毒呈阿斯综合征者，采用大剂量阿托品抢救或用起搏器。值得注意的是恶性疟疾的疟原虫有的对该药已产生抗性。
②阿莫地喹(盐酸氨酚喹啉)：作用与氯喹相似。每片0.25g(基质0.2g)，第1天3片，第2、3天各2片。
③哌喹及哌喹(磷酸哌喹)：本品作用类似氯喹，半衰期9天，为长效抗疟药。哌喹每片含基质0.3g，哌喹(磷酸哌喹)每片0.25g(基质0.15g)，口服首剂基质0.6g，8～12h后再服0.3g(恶性疟0.6g)。哌喹须经胃酸作用成盐酸盐后才易吸收。哌喹(磷酸哌喹)吸收快，味苦。耐氯喹的虫株对本品仍敏感。
羟基哌基(Hydroxypiperaquine)及磷酸羟基哌喹(Hydroxypiperaquine phosphate)与哌喹类同，但吸收较快，半衰期2～3天。三天疗法恶性疟各服基质0.6、0.6、0.3g;良性疟疾各服0.6、0.3、0.3g。较哌喹类更适用。
④奎宁(硫酸奎宁)：本品系金鸡纳树皮中的一种生物碱。抗疟作用与氯喹大致相同，除较迅速杀灭红内期原虫外，还有退热作用。但该药半衰期短(10h)，味苦;对中枢有抑制作用，表现为头昏，耳鸣和精神不振;对心脏有全面抑制作用，静注可出现血压下降;对子宫能增加其收缩力，可引起流产;因此该药仅用于抗氯喹的恶性疟疾及重症病例的抢救。片剂每片0.3或0.12g，口服第1～2天0.45～0.6g，3次/d，第3～7天0.3～0.6g，2次/d。奎宁(二盐酸奎宁)仅在凶险疟疾时考虑使用。
⑤甲氟喹(盐酸甲氟喹)：适用于治疗各型疟疾及有抗性的病例。一次顿服4～6片(1～1.5g)。
⑥硝喹(Nitroquine)：本品对各种疟疾及抗氯喹虫株均有效。每片基质12.5mg，常与氨苯砜复方，各含12.5mg。口服每天4片，连服3天;3岁以下服1/4片。72h方能控制症状，故作用较慢。
⑦青蒿素：该药作用于原虫膜系结构，损害核膜、线粒体外膜等而起抗疟作用。其吸收特快，很适用于凶险疟疾的抢救。总剂量2.5g，首次1.0g，6h后0.5g，第2、3天各0.5g。因排泄迅速，故易复发。蒿甲醚，肌注首剂0.2g，第2～4天各0.1g。
⑧其他新药：磷酸咯啶(Pyracrine phosphate)每片0.1g，首剂3片，以后2片，2次/d，疗程2天。咯萘啶(磷酸咯萘啶)疗程2天，各服基质0.8、0.4g。丫索啶(Azacrin)疗程3天，各服0.6、0.3、0.3g。半免疫者可服单剂0.6g。