抗癫痫药物的不良反应较多，发生机制比较复杂，涉及多个系统，部分可停药而痊愈，有些却能造成不可逆的损伤。因此在临床诊治过程中应做好防治工作。用药前问清患者及家庭患病史和药物变态反应史；用药剂量正规化、合理化；用药期间定期密切观察患者用药后情况监测患者各项生理指标，条件具备时应定期对患者进行血药浓度监测；由于该类药物之间或与其他治疗药物之间相互作用较多，应尽量减少合并用药；出现不良反应，应采取相应措施给予治疗。
(1)皮肤损害：有些抗癫痫药物引起的常见的不良反应，多数为良性皮疹，少数为严重皮肤损害。尤其注意服药1--2周应密切观察。
(2)血液系统损害。
(3)中枢神经系统常见的不良反应为头晕、头痛、乏力、疲劳、注意力不集中等，但症状不明显，对正常生活、学习无明显影响，多为一过性，随着服药时间的延长或减量后症状缓解。
(4)心血管系统的不良反应：卡马西平、苯妥英钠、拉莫三嗪、苯巴比妥等引起的心血管系统的不良反应的表现有心律失常，如窦性心动过缓、窦性停搏、频发室性前期收缩、阿-斯综合征等。卡马西平致阿-斯综合征，患者出现严重窦性心动过缓。由于严重的心动过缓致心排血量明显减少从而使脑供血量不足。所以卡马西平对于原有心血管系统严重疾患者应慎用。
(5)消化系统的不良反应：抗癫痫药物引起消化系统的不良反应为严重肝功异常、慢性胰腺炎、胃出血、食管气管瘘等。
(6)内分泌的不良反应：主要表现为男性乳房发育、闭经、溢乳等。其机制可能与下列因素有关：诱导肝微粒体酶加速激素的代谢；下丘脑和或腺垂体叶功能受干扰；抗癫痫药物对内分泌腺的直接影响。
(7)淋巴系统的不良反应：主要的不良反应为淋巴结肿大、假性淋巴瘤综合征、淋巴瘤等。
(8)全身性损害：主要表现为多系统损害、发热、死亡等。
(9)其他：抗癫痫药物还可引起癫痫恶化、胎儿死亡、低钠血症、胎儿畸形等不良反应。几乎所有抗癫痫药物都有潜在致畸作用，联合用药危险性更大。