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判断 RNA 中基因组 DNA 污染的其他常用方法

作者:中华医学网发布时间:2026-04-10 10:22浏览:

判断 RNA 中基因组 DNA 污染的其他常用方法

 
  1. -RT 对照 PCR(无逆转录酶对照)
     
    不加逆转录酶,直接以 RNA 为模板进行 PCR。若仍出现目的条带,说明存在基因组 DNA 污染。
     
  2. 琼脂糖凝胶电泳
     
    总 RNA 电泳时,在 28S rRNA 上方出现高分子量条带或弥散拖尾,提示有基因组 DNA 污染。
     
  3. qPCR 熔解曲线分析
     
    若出现与 cDNA 不符的异常熔解峰,或无逆转录对照出现明显扩增曲线,可判断存在 gDNA 污染。
     
  4. 特异性核酸染料检测
     
    使用仅对双链 DNA 强染色的染料,若在 RNA 样品中检出明显荧光信号,提示存在 DNA 污染。
     
  5. 限制性酶切验证
     
    用仅切割 DNA 不作用于 RNA 的限制性内切酶处理样品,处理后电泳条带消失,证明污染为 DNA