跨内含子引物 PCR 法判断基因组 DNA 污染的原理

1. 真核生物的基因组 DNA中，基因由外显子 + 内含子组成；而 **cDNA（逆转录产物）** 是 mRNA 经剪接而来，不含内含子，序列更短。
2. 设计引物时，将上游引物和下游引物分别位于两个不同外显子上，且中间跨越一个内含子。
3. 若 RNA 模板无基因组 DNA 污染：
    
   扩增模板只有 cDNA，产物为短片段。
4. 若 RNA 模板存在基因组 DNA 污染：
    
   会同时扩增出 ** 长片段（基因组 DNA）** 和短片段（cDNA）。
5. 电泳后若出现比预期 cDNA 条带大的片段，即可判断存在基因组 DNA 污染。