PCR 引物 Tm 值(解链温度) 常用三种计算方法,按精度从低到高给你整理,考试和实验都够用。
一、最简单粗略公式(<25bp,手工估算)
Tm = 4(G+C) + 2(A+T)
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G+C:引物中 GC 碱基总数
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A+T:引物中 AT 碱基总数
适用:短引物、粗略估算、考试填空。
二、较准确公式(常用标准估算)
Tm = 81.5 + 0.41 (% GC) - 675/N - 引物配对错配率
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N = 引物碱基数
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%GC = (G+C)/N × 100%
适用:15~35 bp 引物,常规 PCR 设计。
三、最准确:最近邻法 Nearest Neighbor(软件用这个)
公式复杂,手工无法计算,由软件自动计算:
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考虑相邻碱基相互作用
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考虑盐浓度、引物浓度
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结果最接近真实 PCR 条件
常用软件:
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Primer3、OligoCalc、NCBI Primer-BLAST、SnapGene
四、实验实用经验(最关键)
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一对引物 Tm 差 ≤ 2℃
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常用退火温度:Tm - 5℃
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理想 Tm 范围:55~65℃
五、一句话总结
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手工估算:4 (G+C)+2 (A+T)
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标准计算:81.5+0.41% GC−675/N
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精准计算:用软件最近邻法