肿瘤临床全基因组测序（WGS，肿瘤 + 配对正常胚系双样本、30×~100× 临床深度）的成本，核心分纯测序耗材成本、临床完整检测收费、动态监测 / 重分析附加成本三部分，2026 年国内主流区间如下：
一、核心成本构成（国内，2026 年）
1. 纯测序 / 试剂硬成本（实验室端，不含分析、报告、 overhead）
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单样本 30× 标准深度（科研 / 批量）：¥800~1,500 / 样本（耗材 + 测序）
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肿瘤临床标准（肿瘤 60×+ 正常 30×，双样本配对）：¥2,500~4,000 / 套（硬成本）
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高深度（肿瘤 100×+ 正常 50×，用于 MRD、低频耐药、结构变异）：¥4,000~6,000 / 套
2. 临床完整检测收费（医院 / 第三方医检所，含建库、测序、生信分析、遗传咨询、报告、质控）
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基础临床版（30×/60×，常规驱动 / 靶向 / 免疫标志物）：¥12,000~18,000 / 套
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深度临床版（100×，含 HRD、复杂 SV、新抗原、MRD 基线）：¥18,000~25,000 / 套
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科研 / 批量（无临床报告、仅原始数据）：¥8,000~12,000 / 套
对比：肿瘤大 Panel（500~1,000 基因）：¥6,000~10,000；全外显子 WES：¥8,000~12,000
3. 动态监测 / 附加成本（全程管理）
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MRD/ctDNA 随访（基于 WGS 定制 Panel，1000×+ 深度）：¥3,000~6,000 / 次
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数据重分析（新药物 / 新靶点，复用原始 WGS 数据）：¥2,000~4,000 / 次
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长读长 WGS（解析复杂 SV、融合）：¥25,000~40,000 / 套
二、影响成本的关键因素
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测序深度：30×（基础）→60×（临床标准）→100×（高敏），深度每翻倍，成本增 30%~50%
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样本类型：FFPE 石蜡样本（降解、需优化）比新鲜组织 / 血液贵20%~30%
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分析深度：仅基础变异（SNV/InDel/CNV） vs 含 SV、融合、HRD、TMB/MSI、新抗原、胚系筛查，后者贵30%~80%
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机构与通量：第三方医检所（批量）比三甲医院（小批次）低15%~30%；集采 / 科研项目可降至 **¥10,000 以内 **
三、医保与支付现状（2026）
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国内肿瘤 WGS 暂未纳入医保，基本全额自费；仅部分单靶点 / 小 Panel（如 EGFR、ALK）可医保报销
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商业保险：少数高端医疗险 / 重疾险可部分覆盖（限晚期、耐药、罕见肿瘤），报销比例30%~70%
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临床试验 / 公益项目：部分中心可免费 / 半价入组
四、成本趋势与性价比
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短期（1~2 年）：随国产测序平台、通量提升，临床收费有望降至 **¥10,000~15,000 / 套 **
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性价比：对不明原发癌（CUP）、罕见肿瘤、多线耐药、HRD/PARP 抑制剂、免疫治疗筛选，WGS 比 Panel 多检出10%~30% 可用药靶点，显著提升治疗获益，长期可降低无效治疗费用