外科是以手术切除、修补为主要治病手段的专业科室。近年，随着显微外科技术的应用，外科得到了较大的发展。各医院外科的专科设置原则与内科类同，通常与内科相对应。
1.普通外科（简称普外）
是外科的基础学科。普外急症多，危重病人多，病情复杂，病人多，流动快，主要收治消化系统、甲状腺、乳腺病及腹部创伤、外科感染等外科疾病。普通外科发展较快，目前已出现进一步分科的趋势，如分为血管外科、肝脏外科、胆道外科、肛肠外科等。目前各种先进的诊断和手术仪器的应用，大大提高了普外疾病的诊疗效果，如红外线乳腺疾病诊断仪、肿瘤诊断仪等是无痛检查，诊断准确率高。腹腔镜用于腹部手术，勿须开刀剖腹，就可以进行胆囊摘除术。
2.心胸外科
也叫胸心血管外科，该科以手术治疗心脏、心脏大血管、肺脏、食道等疾病。如心脏换瓣、冠状动脉搭桥、人造血管移植、胸腔脏器损伤的处理、肺叶切除、食道修补、切除并再造以及气管、支气管成形等手术，都在该科治疗。我国的心胸外科起步较晚，但发展迅速，各种复杂技术已广泛应用于临床，各种手术疗效不断提高。目前，几乎城市的大型医院都能做心脏手术，心脏移植与人工心脏在我国少数医院也有了好的开端。
3.泌尿外科
以收治泌尿生殖系统的疾患(女性生殖系疾患除外)为主，包括肾上腺疾病，主要有结石、肿瘤、创伤、感染、畸形、结核等。随着显微外科技术的应用，如阴茎离断再植、阴茎再造、自体和同体睾丸移植、自体肾或异体肾移植和膀胱再造等手术，都有较大的进展。近些年来，应用肾镜、膀胱镜等泌尿内窥进行泌尿外科手术和体外震波碎石治疗、激光治疗，大大降低了开放手术率，使病人免受开刀之苦。经尿道的前列腺电切手术，可与国外同类先进技术媲美。
4.矫形外科
传统叫骨科。随着医学的发展，矫形外科又分化出多个专业，如手外科、足外科、脊柱外科、关节外科、骨肿瘤等专业。顾名思义，哪一个部位的骨头得了病或受了伤，就到哪个专业去就诊。显微外科技术的应有使这个专科得到了极大发展，各种断指、断肢再植术，吻合血管的指(趾)再造术，吻合神经血管的皮瓣、肌皮瓣移植修复术等，达到国际先进水平。人工关节置换、脊柱侧弯矫形、先天性髋关节脱位的治疗、骨关节融合术、颈腰段椎间盘手术、脊柱结核的外科治疗和各种骨创伤并发症的处理等，也属于骨科的业务范围。正如俗语所说：“伤筋动骨一百天”，因此该专科病人住院时间长，周转慢，医疗需求矛盾比较突出。
5.神经外科
也叫颅脑外科。收治的研究颅内和脊椎管内疾病，如大(小)脑半球肿瘤切除、脑动静脉畸形手术、各种颅脑外伤的处理、脑肿瘤切除、颅内血管性疾病的人工栓塞等。当前，我国颅脑外科已相当普及，开颅手术已由表及里，由浅入深地向脑的重要功能区──脑干发展。脑立体定向技术、胎脑组织移植术及各种先进诊疗仪器的应用，大大提高了颅脑外科疾病的诊断治疗水平。
6.烧伤、整形科
多数医院根据烧伤病人都需要整形的特点，将两个专业合为一个科。但部分条件好的医院，则分别设为烧伤科和整形科。烧伤科收治各种物理和化学物质所致的烧伤、烫伤和灼伤。我国的烧伤救治技术在世界上处于领先水平。整形外科以组织移植为主治疗各种先天和后天的畸形(含烧伤后疤痕所致的畸形)，修复缺损，恢复或改进功能，改善外形，包括任何部位畸形和缺损的整复。我国整形外科发展迅速，不少临床技术已达到国际水平。如一次性手术完成再造耳、鼻、眼睑、唇、颌骨、乳房和阴茎等，其功能形态良好。上述专科手术整形治疗，在没有整形外科的医院，分别由各专业外科施行。