几个重要阶段综合治疗
唇腭裂治疗的现代概念，已不再是单纯的手术修复仅仅满足解剖结构的修复和外形的改善，而是通过矫形－外科－正畸－语音的综合治疗，到达恢复正常解剖形态，重建咀嚼言语功能，改善外貌畸形，促进心理社交健康的全面治疗。
唇腭裂序列治疗历经患者出生到长大成人，随着生长发育的每一阶段，按照一定的程序，治疗其相应的形态、生理、心理缺陷。主要分为以下几个阶段，各个阶段的手术治疗前后均有相应的综合治疗。
出生后2个月内，术前正畸，佩戴活动矫正器（NAM）做牙槽塑形，辅助喂养指导。
出生后3-6个月，唇裂修复手术修复外在最明显的唇裂缺陷。
1-2岁
出生后1-2岁，腭裂手术，主要目的是关闭腭部裂隙，恢复说话需要的腭部解剖结构，手术可能影响颌骨发育但对语音的恢复至关重要，颌骨发育的问题可以通过之后的正畸正颌治疗矫正。此时是幼儿牙牙学语阶段，可接受语音训练指导，家庭教育为主。
因为孩子的身体在不停地发育生长，所以不排斥手术成功后还有继发畸形，如果一旦发音或者其他方面有结构性障碍，需要到口腔颌面外科进行第二次修复。
8-10岁
大概8到10周岁的时候，是修复牙槽骨缺损和干预牙齿萌出困难的最佳时机，孩子需要接受牙槽突裂植骨手术和术前术后正畸。目的是：恢复牙槽突的连续性，有利于恒牙在正常位置萌出，或为牵引萌出障碍的牙齿创造足够的骨床空间以容纳恒牙，减小唇部及鼻翼基底部的塌陷畸形，封闭口－鼻腔瘘。
严重的上颌骨发育不足植骨术后可进行牙弓扩大术和牵引成骨术纠正上颌骨太小的问题。
16-18岁
16-18岁，生长发育完成后，唇腭裂患者往往因上颌骨发育不足导致骨性反颌。为改善容貌和纠正反颌，需要接受正颌正畸联合治疗。最后进行对软组织鼻唇可根据个人意愿进行II期整形进一步改善外貌。