乙肝病毒相关抗原抗体包括乙肝表面抗原和抗体、乙肝核心抗原和抗体、乙肝e抗原和抗体。在乙肝病毒感染的不同时期，至少存在一种血清标志物。用于鉴别是急性感染、或已经根除、或是慢性感染的常用血清标志物是乙肝表面抗原、核心抗体和乙肝表面抗体。
乙肝病毒e抗原和e抗体的检测用于慢性乙肝病毒感染者的治疗评价。由于乙肝病毒核心抗原在血液中含量极少，所以乙肝标志物的检查不包含乙肝病毒核心抗原。
血清乙肝表面抗原首次阳性提示急性乙肝病毒感染。只要乙肝表面抗原阳性就应该认为存在乙肝病毒感染。在新感染的前3-5周只能检测到乙肝表面抗原。从暴露到检测出乙肝表面抗原的平均时间是30天（6-60天）。
急性乙肝病毒感染时，患者可突然出现症状或肝功异常，并出现乙肝病毒核心抗体阳性，核心抗体会伴随终身。检测核心抗体IgM可以鉴别是否为急性感染（或新近感染），急性乙肝肝炎，核心抗体IgM持续6个月。
急性乙肝病毒感染，通常在3-4个月内乙肝表面抗原从血液中被清除，并产生表面抗体。表面抗体的出现提示对乙肝病毒感染有免疫力。乙肝病毒感染自然恢复者，一般都能同时检测到表面抗体和核心抗体，而针对乙肝疫苗的反应只有表面抗体。慢性感染者，表面抗原和核心抗体持续阳性，一般伴随终身。
一些只有核心抗体阳性的慢性感染者血液中可以检测不到表面抗原。核心抗体阳性者，血液中检测到HBVDNA的人群比率为<10%。检测到的核心抗体也可能是假阳性。
一般来说，核心抗体的阳性率与人群中乙肝病毒的感染率相一致。在HBV感染高流行区，表面抗体阴性而核心抗体阳性似乎提示为既往感染。在HBV感染低流行区，血清标志物中核心抗体的阳性率约10%-20%，并常出现假阳性；这些人给予3剂乙肝疫苗大多数可自发产生表面抗体。