尿毒症（30%）：
尿毒症，血中毒性物质蓄积中毒，是由于慢性肾小球、慢性肾盂肾炎和肾小动脉引起慢性肾功能衰竭，尿素明显升高，影响脑代谢功能，引起障碍。
脑内氨基酸代谢异常（30%）：
由于中毒性有机酸的蓄积，脑部血循环障碍并且脑内毛细血管通透性增加，而引起神经细胞与胶质细胞膜特性改变，蓄积的有机酸妨碍脑的脉络丛移除神经递质代谢产物和阻断胶质细胞的传导作用，并可改变Na+一K+泵功能，脑内ATP酶活性降低，使脑对ATP酶的利用能力下降，结果脑内ATp 升高，使磷酸果糖酶的活性受到抑制，从而阻断糖的酵解作用，并影响氧的消耗，脑的代谢率降低，突触传递受到干扰，神经元之间相互作用减弱，脑功能即减退。
其他因素（25%）：
肾功能衰竭时体内的代谢废物不能从泌尿系统排除，造成酸碱平衡失调，氮质代谢产物、胍类底物包括甲基胍、琥珀酸胍、二甲基胍、肌酸、肌酐等都升高，造成脑、肝、肾组织的耗氧异常，引起肾性脑病。
据报道50%～60%的患者在肾功能减退1年内就可出现神经精神症状，58.8%～82%未经透析的慢性肾衰的患者有神经系统损害。若肾衰竭发展至终未期的患者，几乎全部有神经精神症状。