巨细胞病毒感染(CMV感染)的自然史很复杂，在原发性感染以后排毒，往往持续数周、数月甚至数年，然后感染转为潜伏。常有复发感染伴重新排毒。甚至在原发感染后很多年，潜伏病毒再激活，也可能有不同抗原性病毒株的再感染。CMV感染的临床表现与个体免疫功能和年龄有关。不论从垂直感染、平行传播或医源性感染所出现的症状与体征都是多种多样的。
CMV感染症临床经过与病型(Baerlocher等)
1.新生儿感染(先天性)
a.重症型：黄疸、贫血、肝脾肿大、血小板减少性紫癜，侵犯中枢神经，肺炎，心肌炎)
b.轻症型：假死，心脏肥大，高胆红素血症
2.出生后无症状期，乳儿期再感染CMV(先天性/后天性)
a.全身型
b.呼吸系型(百日咳样)c.肝脾肿大
d.胃肠型
e.肾型
3.后天型
a.流感型
b.单核细胞增多症型
c.呼吸系型
d.胃肠型
e.肝炎
f.因特殊医疗防御能力低下
g.无症型
4.1、2、3项的后果即精神、运动发育迟缓