手足口病与疱疹性咽峡炎是表亲，来自同一个大家族，二者症状与传播途径极为相似，都有可能出现发热、咽痛及口腔和咽峡部的疱疹。但又有所区别。疱疹性咽峡炎也是由肠道病毒感染引起的急性上呼吸道感染性疾病，其中最常见的是A组柯萨奇病毒，EV-71和其他肠道病毒也会致病。部分孩子也有可能会发展成为手足口病。从并发症来说，手足口病要更重些、危险些。
手足口病与疱疹性咽峡炎一年四季都会有，但是高发期在每年的4~7月份。
一、疱疹位置不同
疱疹性咽峡炎
临床症状：
反复发高热38℃以上，高热时可发生惊厥；
伴有咽喉痛、头痛、厌食；
口腔可出现针尖大小灰白色疱疹，周围有红晕；
一般其他部位不出现疱疹。
手足口病
临床症状：
口痛、厌食和低热约2天；
口腔黏膜疹：粟米大小斑丘疹或水疱，周围有红晕；
皮肤斑丘疹或疱疹：1~2天可见，常见于手掌、足底、臀部，疱疹呈圆形或椭圆扁形凸起，米粒到黄豆大小不等。
二、引起重症的几率不同
疱疹性咽峡炎虽然可能合并细菌感染，但很少引起严重并发症。
但如果宝宝感染了由EV71型病毒引起的手足口病，应提高警惕并多关注宝宝的病情进展。因为80%手足口病重症病例和90%手足口病死亡病例均由此病毒引起的。
不过，当宝宝被诊断为疱疹性咽峡炎时，要密切注意病情的变化，观察手、足、臀部、肛门周围有无出疹；多给孩子喝水，体温过高时适当降温。如果宝宝出现高热、惊厥、意识模糊等症状，要及时送到医院诊治。
三、传播途径
两种疾病都具有传染性，传播途径有：
直接接触
接触被病毒污染的物品
空气飞沫
饮食被病毒污染的水或食物
（1）宝宝患了手足口病或疱疹性咽峡炎，一定要遵照医嘱住院或居家隔离治疗，等症状消失1周后再去学校或托幼机构；
（2）居家隔离治疗患儿时，家长要密切关注患儿病情变化，做好家庭卫生消毒与隔离工作，避免患儿与其他儿童接触，以减少交叉感染的机会。
四、预防方法
勤洗手。饭前便后、外出回家后都要用肥皂或洗手液，用流动的水给孩子洗手。看护人接触孩子前、换尿布、处理粪便后也要洗手。消毒液要用含氯消毒液，酒精是没有用的。
注意孩子的用品及环境卫生。孩子的奶瓶、奶嘴及餐具使用前充分清洗、消毒。住所经常通风，勤晒衣被。注意食品卫生，尽量给孩子吃熟食，喝开水。
养成规律作息。让孩子保持生活规律，不要太晚睡，不要过于劳累，经常带孩子到户外进行适当的体育锻炼，能够提高免疫力，增强抵抗力，少生病。
流行病的高发季节尽量避免带孩子到人多、拥挤的公共场所或者是不通风的地方，避免接触患病儿童。