一、病毒学失败
在治疗失败过程中最早出现的是病毒学失败。可以从以下5个方面定义：
1、病毒学失败
未能达到抑制病毒复制并维持HIVRNA＜400拷贝／毫升；
2、病毒抑制不完全
患者在接受抗病毒治疗后24周后，连续2次血浆中HIVRNA＞400拷贝／毫升（患者病毒载量基线值的高低会影响到对药物的反应时间，某些治疗方案比其他方案需要更长的时间才能够完全抑制病毒）；
3、病毒反弹
病毒曾经被完全抑制，但是目前可以检测到HIVRNA＞400拷贝／毫升；
4、持续低水平病毒血症
病毒载量可以检出，但HIVRNA＜1000拷贝／毫升；
5、一过性病毒血症
病毒被完全抑制后，偶尔一次可以检测到HIVRNA，但随后又回到检测线以下。
二、免疫学失败
无论病毒是否被完全抑制，CD4+T淋巴细胞计数下降到或低于治疗前的基线水平，或降低至峰值的50%，或持续低于100个／mm3，均可考虑发生了免疫学失败。CD4+T淋巴细胞计数的平台期，通常发生在治疗后病毒被完全抑制的4～6年后。
三、临床失败
抗病毒治疗至少3个月以后，先前的机会性感染重新出现，或者出现预示临床疾病进展的新的机会性感染或恶性肿瘤，或者出现新发或复发的WHO临床分期Ⅳ期疾病，可考虑发生了临床失败，但需注意以下几点：
1、应与免疫重建综合征相区别
免疫重建综合征的特征是艾滋病期有效的抗病毒治疗开始后几周出现机会性疾病的症状和体征，是针对既往亚临床机会性感染出现的炎症反应，这种免疫学重建也可能会导致一些机会性感染的非典型出现。
2、结核病的复发
结核病的复发不一定表明HIV感染的进展，因为还可能再次感染结核病，需要进行临床评估。