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Medline数据库使用方法与技巧

作者:admin发布时间:2010-03-05 12:02浏览:

 MEDLINE《美国全科医学文献数据库》1966-


编辑出版单位:美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)
三种重要的纸本医学文献检索工具:
《Index Medicus》(医学索引)

《Index to dental Literature》(牙科文献索引),

《International Nursing Index》(国际护理索引)


收录范围:基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、卫生保健及预防医学等
光盘出版发行单位:Silver Platter(银盘)
更新周期:月更新


MEDLINE光盘简介
收录了1965年以来
世界70多个国家和地区出版的
大约3900余种生物医学核心期刊的文献题录和文摘
累计文献量已达1200万篇
并以每年40万条记录递增
88%的文献原文是英文
76%的文献有英文摘要

MEDLINE光盘简介

到目前为止,全世界有近20家出版商获准转换MEDLINE数据库,发行MEDLINE的光盘产品,其中包括SilverPlatter(银盘)、Cambridge、DIALOG、OVID等公司
银盘公司出版的MEDLINE光盘数据库是我国医学相关部门进口数量最大,使用频率最高的医学文献光盘数据库

MEDLINE光盘数据库字段

MEDLINE光盘数据库字段

TI: Kharakteristika kDNK gena rpa43+ Schizosaccharomyces pombe: strukturnoeskhodstvo sub''edinitsy Rpa43 RNK-polimerazy I s sub''edinitsei Rpc25 RNK-polimerazy III.

[Characteristics of the cDNA of the Schizosaccharomyces pombe rpa43+ gene: structural similarity of the Rpa43 subunit of RNA-polymerase I with the Rpc25 subunit of RNA-polymerase III]

AU: Shpakovskii,-G-V; Shematorova,-E-K

AD: Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia. gvs@ibch.siobc.ras.ru

SO: Bioorg-Khim. 1999 Oct; 25(10): 791-6

IS: 0132-3423

PY: 1999

LA: Russian; Non-English

CP: RUSSIA

AB: We isolated and characterized full-length cDNA of the rpa43+ gene encoding one of subunits of the nuclear RNA polymerase I of Schizosaccharomyces pombe. ……

MESH: *RNA-Polymerase-I-genetics; *RNA-Polymerase-III-genetics; *Schizosaccharomyces-genetics

MESH: Amino-Acid-Sequence; Base-Sequence; DNA,-Complementary; Molecular-Sequence-Data; RNA-Polymerase-I-chemistry; RNA-Polymerase-III-chemistry; Sequence-Homology,-Amino-Acid

TG: Animal

PT: Journal-Article

SH: chemistry; genetics

RN: 0; EC 2.7.7.-; EC 2.7.7.-

NM: DNA,-Complementary; RNA-Polymerase-I; RNA-Polymerase-III

SI: GENBANK/AF129106

SB: Index-Medicus

UD: 20001218

AN: 20110078

XREC: ABSTRACT (AB)


MEDLINE光盘数据库单元记录实例

常用的逻辑运算符
逻辑与:AND
逻辑或:OR
逻辑非:NOT

常用的位置运算符

位置算符with:
检索式:A with B表示检索词A和检索词B不仅同时出现在一条记录中,还要同时出现在一个字段里。


位置算符near:
检索式:A near B表示检索词A和检索词B不仅同时出现在一条字段里,还要同时出现在一个句子里。Near n表示0—n-1个间隔。

运算符的优先级顺序
在一个检索式中,可以同时使用多个逻辑运算符,构成一个符合逻辑检索式
运算符的优先级为:
NOT > NEAR > WITH > AND > OR

如果有( ),则先运行( )的运算。

截词符、通配符、连缀符


截词符“*”
Immun*=immunology, immune, 等等


通配符“?”
colo?r = color, colour

连缀符“-”
interleukin - 6

WinSpirs的检索界面

动WinSpirs软件后,有五个主要的界面:

数据库选择屏(Database);
数据库版权页(SilverPlatter MEDLINE (R));
检索屏(Search);
索引屏(Index);
叙词屏(Thesaurus )

数据库选择屏
Database
数据库版权页
SilverPlatter MEDLINE (R)
检索屏
Search
标题栏

菜单栏
按钮栏

检索词输入区
检索词显示区
命中结果状态区及命中结果显示区
检索屏
索引屏
Index

叙词屏/主题词屏
Thesaurus


不是主题词会设参见词条,因此须更换词条查找。

检索方法与技巧


自由词检索:Search屏
限制性检索: Search屏状态下用限定词完成的检索。限定词:in、=
主题词检索:Thesaurus屏
索引词检索:Index屏

自由词检索(SEARCH)


点击Searches按钮进入检索屏检索,在Search:提示符后输入检索词
字母或数字组合 123,abc,3m等
单词检索 LIVER
词组检索 LIVER CARCINOMA
连缀检索  LIVER-DISEASE
截词检索  IMMUN*
通配符检索 COLO?R
逻辑式检索  LIVER and CT
以前检索式  #5

Drug与abuse在同一文摘字段中,但不在同一句话中
Drug与abuse之间间隔了0至2个单词
命中结果显示区的自由词检索

在命中结果显示区内,浏览检索结果时,发现更好的词或词组,可以把这个词或词组选中
按“add to search”键进行检索
这种检索又成为横向检索。

限定检索(SEARCH)

在Search:提示符后的检索词输入区内,对任何自由词可用“in”或“=”等限定符加上字段标识符指定在某个字段内检索。
例如:
leukocytes in ti(文章题目)
hamilton-ta in au(作者)
py(出版年)>=1996
epilepsy in mesh(主题词)
j-am-dent-assoc in so(刊名)
aids and ai=ab
beijing medical university in ad(作者地址)
检索综述文献时,输入review in pt(pt代表出版类型)

限定检索(SEARCH)
限定检索(SEARCH)
限定检索(SEARCH)
检索在MeSH主题词表中标注了hypertension的综述文章

主题词检索(THESAURUS)


主菜单下选“Thesaurus”项,或按功能键F9,进入主题词检索;
输入相应的检索词,回车,进入主题词轮排表;
选定主题词后回车,进入主题词显示状态,包括主题词相关参照、回溯注释、树状结构等
可以移动光标在屏幕上选择上下位主题词,方便进行扩检或缩检;
选“Explode”项,对所选主题词及其下位词进行检索;
选“Single Term”项,对所选主题词(不包括其下位词)进行检索;

主题词检索(THESAURUS)


执行检索命令后,进入副主题词选择菜单;
选择副主题词,可选“全部副主题词”或按要求选恰当的副主题词进行组配检索;
选“Ok”项,开始检索;
选“Description”项,系统显示光标所在副主题词的定义及适用范围等

轮排索引

注释信息


树型结构


默认为扩展检索

副主题词表选择屏

主题词检索(THESAURUS)

主题词单检
HYPERTENSION
主题词扩检
explode HYPERTENSION


主题词检索(THESAURUS)

主题词检索(THESAURUS)
MeSH主题词中检索hypertension关于并发症和死亡率方面的文章,“single term”结果1967篇

主题词检索(THESAURUS)

主题词检索(THESAURUS)

MeSH主题词中检索hypertension关于并发症和死亡率方面的文章,“explode”结果2451篇
检索屏下的叙词检索

使用符号“/”。例如:heart/physiology
使用连字符:-。例如:liver-neoplasms
用字段标识符限定。liver in MeSH
索引词表检索(Index)

索引词表包括所有可检字段中的字、词及主题词等,主要用于选择检索词并进行检索,检索字段为所有非限定性字段(等同于search)
在主菜单下选“Index”命令,或按功能键F5
输入检索词,显示索引词表;
选择检索词;
选“search”项,开始检索
选“limit”项,可对检索结果作相应的限定

索引词表检索(Index)

其他操作

检索结果操作:
Show 显示 Print 打印
Download 套录 Options 参数设置

检索史操作:
History 检索策略 Clear 清检索式
系统操作:
Database 换库 Restart 初始化
Help 帮助 Exit 退出

标记记录

标记记录

打印结果

套录结果

检索史操作

所有上述检索式称为“检索史”,可对检索史进行编辑,清除,保存和再次套用

编辑

清除
检索史操作

再次套用检索史

系统操作

其它操作

检索MEDLINE中的循证医学文献


举例:有关肝癌诱发因素方面的文献

A、肝癌与最佳限定词组配

#1 "Carcinoma-Hepatocellular"/ all subheadings

#2 risk in ti,ab,mesh

#3 #1 and #2

B、达到最佳查全率

#1 "Carcinoma-Hepatocellular"/ all subheadings

#2 exp cohort-studies

#3 exp risk

#4 (odds and ratio*) in ti,ab,mesh

#5 (relative and risk) in ti,ab,mesh

#6 (case and control*) in ti,ab,mesh

#7 #2 or #3 or #4 or #5 or #6

#8 #1 and #7

C、达到最佳查准率

#1 "Carcinoma-Hepatocellular"/ all subheadings

#2 control-studies

#3 cohort-studies

#4 #2 or #3

#5 #1 and #4

检索MEDLINE中的循证医学文献


举例:检索ramipril随机对照试验(RCT)及对照临床试验(CCT)

#1 "Ramipril"/ all subheadings

#2 randomized-controlled-trial in pt

#3 controlled-clinical-trial in pt

#4 explode "Controlled-Clinical-Trials"/ all subheadings

#5 "Random-Allocation"

#6 "Double-Blind-Method"

#7 "Single-Blind-Method"

#8 #2 or #3 or #4 or #5 or #6 or #7

#9 (TG=animals) not ((TG=human) and (TG=animals))

#10 #8 not #9

#11 #10 and #1

#12 #1 in mjme

#13 #12 and #10

小结


检出文献过少时,如何扩大检索范围(查全)
1、用主题词表(扩展检索,选用多个主题词等)

2、用“OR”运算符扩大检索范围

3、采用截词检索(词根或词尾上加*)

4、用通配符“?”检索

5、用索引词表(Index)检索

6、取消检索词之间的连接符“-”

检出文献过多时,如何缩小检索范围(查准)
1、用主题词表(组配副主题词,加权(in mjme),选择更专的下位词)

2、应用限定字段检索(选择“limit”功能按扭限定字段)

3、用运算符缩小检索范围(and,with,near,not)

4、用索引词表(Index)检索

5、屏幕浏览选找主题词

6、通过“Suggest”功能选词

小结
为了提高查全率和查准率,对于不同的检索内容应选择不同的检索途径,并进行合适的组配。
采用主题词检索,不但可以很容易地检索宽广的概念,提高查全率,而且不必考虑自由词的各种变化形式,提高检索速度。所检索的数据库如有主题词表,一般优先选用主题词检索。要使用主题词表时要注意它的历史演变。对于很专指或最新的概念,主题词表一般不能及反映出来,不宜采用。
采用自由词检索,可以使用任何专用名词、术语、代号等进行检索,而不需把主题翻译成一定代码和专门术语。由于学科的发展,各种新词术语的出现不能及进反映到主题词表中,以及人名、商品名、机构名、缩写等的千变万化,特别是主题词不能充分表达文献内容时,只能用自由词检索。自由词的词汇量大,能及时检索新词术语。自由词检索的缺点是没有总称和总容量,不能检索宽广的概念。由于不能解决同义词,近义词及词与词的关系,也影响查全率。