黄芪注射液会出现的副作用是偶见过敏反应。对于心气虚损、血脉瘀阻之病毒性心肌炎、心功能不全及脾虚湿困之肝炎的患者，使用黄芪注射液治疗注意事项有以下几点：
黄芪注射液不宜在同一容器中与其它药物混用。黄芪注射液是纯中药制剂，保存不当可能影响产品质量，所以使用前必须对光检查，发现药液出现混浊﹑沉淀﹑变色﹑漏气等现象时不能使用。
新生儿、婴幼儿禁用。儿童用药应严格按公斤体重计算。对孕妇、哺乳期妇女的安全性尚未确立，请谨慎使用。尚无本品与其他药物相互作用的信息。
对黄芪注射液有过敏反应或严重不良反应病史者禁用。过敏体质者禁用。黄芪注射液为温养之品，心肝热盛，脾胃湿热者禁用。新生儿、婴幼儿禁用。家族对本品有过敏史者禁用。