各药品生产企业申请GMP认证，可按下列程序进行。认证工作程序示意图：
一、 资料申报 ← 申请认证企业
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二、 申报资料初审 ← 省药品监管局
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三、 申报资料受理形式审查 ← 国家药品监管局安全监管司
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四、 申报资料技术审查 ← 国家药品监管局认证中心
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五、 现场检查通知 ← 国家药品监管局认证中心
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六、 现场检查 ← 检查组
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七、 检查报告审查 ← 国家药品监管局认证中心
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八、 检查报告审核 ← 国家药品监管局安全监管司
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九、 批准 ← 国家药品监管局领导
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十、 颁发证书、公告 ← 国家药品监管局安全监管司
各工作程序所需时间：
第二个工作程序在二十个工作日内完成；
第三个-第四个工作程序在二十个工作日内完成；
第五个-第六个工作程序在二十个工作日内完成；
第七个工作程序在二十个工作日内完成；
第八个-第九个工作程序在二十个工作日内完成；
从程序开始、到最后批准，整个认证过程，大约需要一百个工作日。
1. 申报资料
根据《药品GMP认证管理办法》第二章规定，申请药品GMP认证的药品生产企业，应填报《药品GMP认证申请书》一式四份，并报送下列资料。
一、《药品生产企业许可证》和《营业执照》复印件；
二、药品生产管理和质量管理自查情况（包括企业概况、GMP实施情况及培训情况）；
三、、药品生产企业（车间）的负责人、检验人员文化程序登记表；高、中、初级技术人员的比例情况表；
四、药品生产企业（车间）生产的组织机构图（包括各组织部门的功能及相互关系、部门负责人）；
五、药品生产企业（车间）生产的所有剂型和品种表；
六、药品生产企业（车间）的环境条件、仓储及总平面布置图；
七、药品生产车间概况及工艺布局平面图（包括更衣室、盥洗间、人流和物料通道、气闸等）并标明空气洁净度等级；
八、所生产剂型或品种工艺流程图，并注明主要过程控制点；
九、药品生产企业（车间）的关键工序、主要设备验证情况和检验仪器、仪表校验情况；
十、药品生产企业（车间）生产管理、质量管理文件目录。
新开办的药品生产企业（车间）申请GMP认证，除报送二至十项规定的资料外，还须报送有关部门同意开办药品生产企业（车间）批准的立项文件和拟生产的品种或剂型三批试产记录 .