种质(germplasm)是指决定生物遗传性状，并将丰富的遗传信息从亲代传递给后代的遗传物质总体。遗传物质是决定生物能否产生活性物质的前提，是决定药材品质的内在因素，种质的优劣对药材的产量和质量有决定性的影响。各种药材含有的活性成分不同，其|生味功能不同，都与其具有的不同种质有关。
药材优良种质的筛选和优良品种的培育是保障和提高药材质量的重要措施。如人参，我国经过上百年的栽培，已形成了十多种不同种质，种质不同，其抗性、根部形态、产量、化学成分、药材质量等均有较大差异；其中在根部形态不同的种质中，大马牙的是产量最高的种质；而在果实颜色不同的种质中，果实颜色为黄色的种质是人参皂苷含量最高的类型；在人参的规范化种植中可以选用不同的种质类型，达到药材生产的不同需求。
在遗传育种领域，把一切具有一定种质或基因，可以用于育种、栽培及其他生物学研究的各种生物类型总称为种质资源(germplasm resoHrces)。种质资源是遗传育种工作的物质基础。对现有的中药种质资源进行系统调查、收集和保存，建立种质资源圃和种子库，并根据不同生产需求对各种质进行综合评价，从中选出具有不同优良特性的优良种质加以利用，并开展良种提纯复壮工作，增强品种和繁殖材料的抗性，提高产量和质量，是生产优质、高产药材的必由之路。