参与蛋白质生物合成的物质（2）

个别例外。

　　一种氨基酸由多种密码子所编码的事实使人想到：同一种氨基酸的一组密码子的使用频率是否相同？许多实验证实，在原核生物和高等真核生物中同一组密码子的使用频率是不相同的。高频密码子多出现在那些表达量高的蛋白质基因中，例如，核糖体蛋白质基因，RecA蛋白质基因等。表18-2。这种使用频率与细胞内一组tRNA中的不同tRNA含量有关。

　　（三）tRNA是氨基酸的运载工具：

　　tRNA在蛋白质生物合成过程中起关键作用。mRNA推带的遗传信息被翻译成蛋白质一级结构，但是mRNA分子与氨基酸分子之间并无直接的对应关系。这就需要经过第三者“介绍”，而tRNA分子就充当这个角色。tRNA是类小分子RNA，长度为73-94个核苷酸，tRNA分子中富含稀有碱基和修饰碱基，tRNA分子3’端均为CCA序列，氨基酸分子通过共价键与A结合，此处的结构也叫氨基酸臂。每种氨基酸都有2-6种各自特异的tRNA，它们之间的特异性是靠氨基酰tRNA合成酶来识别的。这样，携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA称为同功tRNA，它们在细胞内合成量上有多和少的差别，分别称为主要tRNA和次要tRNA。主要tRNA中反密码子识别tRNA中的高频密码子，而次要tRNA中反密码子识别mRNA中的低频密码子。每种氨基酸都只有一种氨基酰tRNA合成酶。因此细胞内有20种氨基酰tRNA合成酶。

图18-3　密码子和反密码子的相互作用

　　tRNA分子中还有一个反密码环，此环上的三个反密码子的作用是与mRNA分子中的密码子靠碱基配对原则而形成氢键，达到相互识别的目的。但在密码子与反密码子结合时具有一定摆动性，即密码子的第3位碱基与反密码子的第1位碱基酸对时并不严格，见图18-3。配对摆动性完全是由tRNA反密码子的空间结构所决定的。反密码的第1位碱基常出现次黄嘌呤I，与A、C、U之间皆可形成氢键而结合，这是最常见的摆动现象。这种摆动现象使得一个tRNA所携带的氨基酸可排列在2-3个不同的密码子上，因此当密码子的第3位碱基发生一定程度的突变时，并不影响tRNA带入正确的氨基酸。

表18－3　反密码与密码碱基配对时的摇摆现象

反密码第1位碱基 A C G U 1 密码第3位碱基 U G C，U A，G A，C，U

　　在蛋白质生物合成过程中，特异识别mRNA上起始密码子的tRNA被称为起始tRNA，它们参加多肽链合成的起始，其它在多肽链延伸中运载氨基酸的tRNA，统称为延伸tRNA。

　　（四）核糖核蛋白体

　　核蛋白体是由rRNA和几十种蛋白质组成的亚细胞颗粒，位于胞浆内，可分为两类，一类附着于粗面内质网，主要参与白蛋白、胰岛素等分泌性蛋白质的合成，另一类游离于胞浆，主要参与细胞固有蛋白质的合成。核糖体是细胞中的主要成分之一，在一个生长旺盛的细菌中大约不20000个核糖体，其中蛋白质占细胞总蛋白质的10%，RNA占细胞总RNA的80%。

　　任何生物的核糖体都是由大、小两个亚基组成，现将大肠杆菌核糖体和大鼠肝细胞核糖体的蛋白质组分和RNA组成列表于18-4。1968年已在体外对大肠杆菌小亚基进行了自我装配研究，加入16s rRNA和21种蛋白质，即可形成有天然活性的30s小亚基。通过这些研究使人们能够进一步认识小亚基和大亚基中rRNA与蛋白质的特异功能。核糖体是高度复杂的体系，它的任何个别组分或局部组分都不能起整体的作用，因此必须研究核糖体中蛋白质和RNA的空间结构和位置，才能更完全地了解蛋白质合成的具体过程。过去一直认为rRNA主要起着结构上的作用，蛋白质发挥催化功能，但现在认为rRNA与蛋白质共同的构成的核糖体功能区是核蛋白体表现功能的重要部位，如GTP酶功能区，转肽酶功能区以及mRNA功能区等等。

表18-4 核蛋白体的组成及特性

来源 直径(毫微米) 重量(道尔顿) 含rRNA（%） 含蛋白质（%） 沉降系数 亚基 含rRNA 含蛋白质种数 每个细胞内含有的个数 种类 分子量 真核细胞胞液 20～22 3.6×106 55 45 77S～80s 40S（小） 18S -70万 ～34 106～107 60S（大） 5s

5.8S

　　28S～29S 3万

4万

　　140～180万 ～40 原核细胞胞液 18 2.6×106 60～65 30～35 70S 30S（小） 16S 55万 ～34 1.5×104 50S（大） 5s

23S 4万

110万

　　注：真核细胞线粒体的核蛋白体组成及特性与原核细胞胞液的相同

　　核蛋白体作为蛋白质的合成场所具有以下几种作用：

　　（1）mRNA结合位点：位于30s小亚基头部，此处有几种蛋白质构成一个上的结构域，负丙与mRNA的结合，特别是16srRNA3’端与mRNa AUG之前的一段序列互补是这种结合必不可少的，见表18-5。

表18-5 大肠杆菌mRNA起始密码上游区域SD序列和16s rRNA的互补　

MS2外壳蛋白

　　MS2复制酶

　　MS2A蛋白

　　λCro

　　galE

　　β-内酰氨酶

　　脂蛋白

　　核糖体蛋白S12

　　RNA聚合酶β

　　trpE 3’HOAU UCCUCCACUAG……5’

5’……UCAACC GGAGUUUGAAUCAUG…3’

　　5’……CAAACAU GAGGAUUACCCAUG …3’

　　5’…… UCCU AGGAGGUUUGACCUGUG…3’

　　5’…… AUGUAC UAAGGAGGUUGUAUG…3’

　　5’…… AGCCUAAU GGAGCGAAUUAUG…3’

　　5’…… UAUUGAAA AAGGAAGAGUAUG…3’

　　5’…… AUCUA GAGGGUAUUAAUAAUG…3’

　　5’…… AAAACCAGGAGCUAUUUAAUG…3’

　　5’…… AGCGAGCU GAGGAACCCUAUG…3’

　　5’…… CAAAAUUAGAGAAUAACAAUG…3’

　　（2）P位点：（peptidyl tRNA site）

　　又叫做肽酰基tRNA位或给位。它大部分位于小亚基，小部分位于大亚基，它是结合起始tRNA 并向A位给出氨基酸的位置（图18-4）。

图18-4　翻译过程中的核糖体图解

　　（3）A位点：（Aminoacyl-tRNA site）

　　叫做氨基酰 tRNa 位或受位。它大部分位于大亚基而小部分位于小亚基，它是结合一个新进入的氨基酰tRNA 的位置（见后节叙述）。

　　（4）转肽酶活性部位：

　　位于P位和A位的连接处。

　　（5）结合参与蛋白质合成的起始因了（Initiation Factor,IF）、延长因子(Elengation Factor,EF)和终止因子或释放因子(Release Factor,RF)。