(一)治疗
肠结核的治疗目的是消除症状，改善全身情况，促使病灶愈合及防止并发症发生，肠结核早期病变是可逆的，因此应强调早期治疗;如果病程已至后期，即使给予合理足时的抗结核药物治疗，也难免发生并发症。
1.休息与营养 机体抵抗力的降低是结核发生、发展的重要因素，因此合理的休息与营养应作为治疗的基础。以增强机体的抵抗力。对活动性肠结核须卧床休息，积极改善营养，必要时宜给静脉内高营养治疗。
2.抗结核化学药物治疗 抗结核药物多达十几种。一般认为，抗结核药物可分为杀菌药和抑菌药两大类。前者指在常规剂量下，药物在机体内外的浓度高于在试管内最低抑菌浓度10倍以上，否则是抑菌药物。有人也习惯于将抗菌作用较强而副作用小的药物划为一线药，其余均划为二线药。1987年全国结核病防治工作会议规定的一线药物有异烟肼、链霉素、对氨柳酸钠、氨硫脲。1992年国际防痨协会/世界卫生组织研究小组主张将异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、链霉素，氨硫脲和乙胺丁醇列为抗结核的主要药物。
药物临床运用应坚持早期、联用、适量、规律和全程使用敏感药物的原则，化疗方案视病情轻重而定，过去一般以链霉素、异烟肼，对氨柳酸钠为首选，进行长程标准化疗，疗程在1～2年。目前为使患者早日康复，防止耐药性的产生，多采用短程化疗，疗程为6～9个月。一般用异烟肼与利福平两种杀菌药联合。在治疗开始1～2周即有症状改善，食欲增加，体温与粪便性状趋于正常。对严重肠结核，或伴有严重肠外结核者宜加链霉素或吡嗪酰胺或乙胺丁醇联合使用，疗程同前。
(1)异烟肼INH：本药具有强杀灭结核菌作用，列为首选和基本的抗结核药物。
①制菌作用：其试管内最低的抑菌浓度为0.005～0.5μg/ml，浓度稍高即有杀菌作用。其杀菌作用与细菌的生长繁殖有关。细菌的生长繁殖愈快，杀菌作用愈强，对静止期的细菌，作用则较差。由于INH的分子穿透性强，能穿透细胞膜进入细胞内和病变组织中，所以对细胞内外的细菌均有杀灭作用。同时，其杀菌作用也不受环境酸碱度的影响。故称之为“全杀菌药物”。其作用机制主要是抑制结核菌的脱氧核糖核酸的合成。单一用本药时，易产生继发性耐药菌。细菌对INH产生耐药性后，由于其致病力降低。耐药菌又有不均一性(即部分细菌并不耐药)细菌的环境再发生改变(如还有其他药物环境或与其他细菌共存的情况)，以及耐药菌生长繁殖时，就有可能恢复对药物的敏感性即所谓“复归”。故临床上多不因查出细菌已对INH耐药而停用本药。
②体内代谢：口服本药后，在小肠内迅速吸收，1～2h血浆浓度达高峰，半衰期约6h。INH进入人体后，主要在肝内进行乙酰化代谢。在乙酰转化酶的催化下，与乙酰辅酶A反应，脱去氨基，生成乙酰异烟肼、异烟酸腙型化合物而失去活性，只有一部分保留的游离INH继续保持其抗菌作用。代谢物主要经肾脏排出。乙酰化的速度有明显的个体差异，可分为快型、中间型及慢型。白种人多为慢型，黄种人多为快型。快型较慢型者疗效稍差，但出现不良反应较少。
③不良反应：使用常规剂量时，很少出现不良反应。主要的不良反应有：
A.肝损害：常发生于老年人或大剂量服用时，一般可出现转氨酶升高，严重者发生肝细胞性黄疸。
B.周围神经炎：多见于男性，大剂量服用者。表现为四肢感觉异常，腱反射迟钝，肌肉轻瘫，形成原因是由于INH的氨基与维生素B6的吡哆醛缩合成腙型化合物，致体内维生素B6排出增加，造成维生索B6的缺乏。对大剂量服用本药者加服维生素B6可以预防周围神经炎的发生。其他不良反应有记忆力减退、头晕、精神兴奋或嗜睡等精神症状，故有癫痫病史者慎用，以免诱发。
此外，偶可出现男性乳房发育。少见的过敏反应有药疹、发热、白细胞减少等。
④用法、剂量：常规剂量为300mg/d(4～6mg/kg)，间歇法用量增至15mg/kg。已证明本药在血中高峰浓度较持续抑菌浓度杀菌效果更好，故采用顿服法。
(2)链霉素(SM)：
①制菌作用：对结核菌最低抑菌浓度为0.5μg/ml。在碱性环境中，对细胞外的生长代谢旺盛的结核菌有杀灭作用，但在酸性环境下，细胞内以及生长代谢低下的结核菌无作用，所以是“半杀菌药”。其作用机制主要是抑制细菌蛋白质的合成。