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国家基因组科学数据中心主任鲍一明:新型冠状病毒与SARS基因组序

作者:中国青年报发布时间:2020-01-24 09:19浏览:

中国青年报客户端北京1月22日电(中青报·中青网记者 邱晨辉)记者从中国科学院北京基因组研究所获悉,依托该所而建的国家基因组科学数据中心1月22日正式发布2019新型冠状病毒资源库。这一资源库的上线,可方便人们及时了解新型冠状病毒基因组序列和病毒基因组变异情况,为科研和疾病防控提供支撑。

中国科学院北京基因组研究所研究员、国家基因组科学数据中心主任鲍一明今天在接受中青报·中青网记者采访时透露,科研人员利用这一资源库,开展了新型冠状病毒基因组变异分析,获取了该病毒株之间、该病毒株与SARS冠状病毒以及与类SARS冠状病毒蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。

经数据分析,2019新型冠状病毒与2003年爆发的SARS病毒基因组序列相似度为80%,与2017年2月从国内的蝙蝠中采集到的相关基因组序列相似性最高,相似度为88%。

“不过,这只是一个初步研究。”鲍一明告诉中青报·中青网记者,病毒之间的基因组序列相似,并不代表其传播和致病能力相似,要搞清楚新型冠状病毒,还需要就病毒基因组内和传播、致病能力相关的特定片段,进行仔细比较分析。

当然,研究病毒之间的基因组序列相似度,可以帮助科学家对新病毒进行溯源和分类。

鲍一明以此次的新型冠状病毒为例,科学家发现其与SARS病毒基因组序列相似度为80%,可以确认它属于病毒界的“冠状病毒”科,“β冠状病毒”属,“严重急性呼吸综合征相关冠状病毒”种,因此在分类学上,它和SARS病毒是同一“种”的。相应地,科学家也可就此初步判断该病毒源头宿主很可能是蝙蝠。

记者登陆今天发布的2019新型冠状病毒资源库网站首页,最先映入眼帘的是关于“冠状病毒”的概念解释:冠状病毒是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。此次在武汉首先发现的冠状病毒是一种先前尚未在人类中发现的病毒株系,被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒。

鲍一明说,通过2019新型冠状病毒资源库,还可访问到国家基因组科学数据中心从公共数据库收录的冠状病毒科基因组和蛋白序列,基于序列号、种名、属名、采样日期、采样地点、宿主、分离源、发布日期等元信息,可以筛选感兴趣的冠状病毒株。

“对2019新型冠状病毒株的基因组变异分析,可为追溯病毒来源、追踪病毒株变异路径、防控新型冠状病毒引发的疫情、治疗病毒性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。”鲍一明说。